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[交流]
【分享】生物科学之文献交流已有4人参与
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我们在同一个平面，同一个圆。 只要张开两臂，就能互牵。 因为，你是我的侧面。 亲爱的朋友们以及朋友们：你们一定读过不少的文献，读过不少的好文献，它们那么的优秀那么的有启示，以至于我们禁不住要做点札记或者札记。那么何不把它分享出来呢？ 把它们记录在这里吧，不需要太详细，不需要很专业，只要大略地描述一下重要的内容就好了。这样后来的虫子就可以看看是不是对自己有帮助，同时也可以看看别人的文献是不是与自己有交叉，无疑方便了大家交流，也省去了大量检索文献翻阅文献的时间，来吧只要大家足够热情，就一定双双互利。 要求：至少写出文献的标题（这个是必须的吧）以及作一下简单的介绍（这个多多益善吧，不过懒的写多也无所谓至少给点信息吧）。 凡跟贴发表者，一律5BB以上的奖励。不信你可以试一下。 |
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酵母细胞中辅酶干扰的代谢影响
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论文总结：以基因引入的手段对酵母的辅酶代谢进行干扰。分别引入了（1）nox来以分子氧氧化细胞质中的NADH成NAD+（2）氧化酶AOX1来强化线粒体中NADH的氧化（3）表达自身的NADH激酶并通过修剪信号肽以控制它的着位点（细胞质中/线粒体）（5）引入转氢酶NADPH和NADH的转化。指出细胞质NADH与甘油形成密切相关，而线粒体NADH与乙醇密切相关；NADPH在生物质的合成中起主要作用，等。 体会：首先作者的手段是比较新颖的，基因操作比较有花样。比如通过信号肽的修剪来控制酶蛋白处位，而且注重了区室效应，分别考察了细胞质和线粒体中辅酶的干扰影响，这是很应该的。同时作者的分析方法也比较新颖，比如对引入的转氢酶进行了热力学分析，以确定或证实真实催化方向。对6种中菌体的表现采用了聚类的图形化分析从而进行直观地比较。 但是显然作者的结果数据也是很泛滥的，以致于看到整篇文献大多是在描述实验现象，提炼出来的规律性东西很少，而且有一些实验现象是难于解释的。同时既然考虑到了区室效应，却没有提到可能的区间运输，这或许也是一些线象难于解释的原因吧。不过毕竟考察的较全面，也很具体，就像作者一直强调的那样，或许能够为我们的以后的工作提供一些有价值的参考吧。 |
10楼2010-06-26 11:50:30
2楼2010-06-26 11:42:04
Flux balance analysis in the era of metabolomics(代谢组学中的通量平衡分析)
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总结：代谢组学正在迅速地向前发展，作为一套高通量数据采集工具，它能客观地描述代谢产物的动力学。现在这些数据还不充分，也不够准确，不能建立起一个大型动力学模型。因此，迫切需要开发一些能利用这些新兴数据并能解释相关不确定性的定量技术。本文探讨了目前FBA在这方面的发展，并且探讨了，FBA作为代谢组学的补充，它的应用以及与代谢组学结合后，两者预期的协同作用。 想法：代谢组学的发展为FBA提供了很充分的数据，尤其是对于大型代谢网络来讲，动力模型的建立还有困难，而FBA将会有很大的应用前景。 |
3楼2010-06-26 11:42:30
4楼2010-06-26 11:42:53