应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【讨论】MS中sorption模块的MC计算
251/3返回列表123下一页
查看: 4500  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

rdw00

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】MS中sorption模块的MC计算 已有6人参与

我在利用sorption模块计算的时候，怎么总是和原文数据不一致？还有forcite优化结构的时候，力场参数都是选dreiding的时候，怎么不能得到文献说的数据结果？是什么原因呢？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MOF相关 多孔材料 我的饕餮

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-06-23 21:17:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-06-24 15:11:50
rdw00(金币+10): 2010-06-24 16:30:59
能说说你具体的设置和体系吗？不然单单这么说很难知道原因，还有文献里的数据也是用sorption做的？
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-24 13:30:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rdw00

木虫 (著名写手)
MOF-5。
forcite的时候得到的晶格常数比文献说的要大。文献也说是dreiding优化的。这个不符合文献。
接下来的吸附H2的时候，想重复试验数据和理论数据，结果也不符合。
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 15:17:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rdw00(金币+15): 2010-06-24 16:31:08
lei0736(金币+5):谢谢 2010-06-25 11:20:59
引用回帖:
Originally posted by rdw00 at 2010-06-24 15:17:34:
MOF-5。
forcite的时候得到的晶格常数比文献说的要大。文献也说是dreiding优化的。这个不符合文献。
接下来的吸附H2的时候，想重复试验数据和理论数据，结果也不符合。

晶格常数不完全一致没有关系，大致差不多就可以了，我记得MOF-5的是25.83左右，在这附近就可以了。
对于吸附，我问你几个问题：
1，文献中H2用的是什么模型，什么力场？单原子模型，Buch力场参数？还是双原子模型，Cracknell力场参数？还是三原子模型，Cracknell或者Zhong的参数？
2，模拟的温度是多少？常温还是77K，如果是77K，是否考虑FH量子效应？
3，对于吸附等温线，文献上是excess还是absolute?
4，文献上用什么工具计算？Sorption？
5，你的输入参数是压力还是逸度？
6，如果H2是三原子模型，你的MOF-5是否带电荷？
先回答我这6个问题，然后我再跟你解释为何有差别。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-06-24 16:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rdw00

木虫 (著名写手)
我的晶格是26.32。文献数据26.02
1。不知道，根据他拟合的力场参数建的新的力场文件。H2的模型和力场参数的影响有多大？怎么影响？谢谢解释下
2。77k，FH量子效应怎么考虑进去？！
3。excess。另一个结构两个数据都有
4。Cerius2。  GCMC。我们老板说这个和MS的sorption一致。
5。逸度，但是比较小，只有 1atm
6。H2三原子模型是什么？ MOF-5整体不带电
要不要加个QQ聊啊，帮忙解释下吧，谢谢了。我才学这个，比较迷茫。
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-24 16:27:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-24 16:01:53:

晶格常数不完全一致没有关系，大致差不多就可以了，我记得MOF-5的是25.83左右，在这附近就可以了。
对于吸附，我问你几个问题：
1，文献中H2用的是什么模型，什么力场？单原子模型，Buch力场参数？还是双原子 ...

看下吧，回答在上面那一楼哦。谢谢

[ Last edited by rdw00 on 2010-6-24 at 16:49 ]
赞一下 回复此楼
6楼2010-06-24 16:29:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+5):谢谢 2010-06-25 11:21:32
引用回帖:
Originally posted by rdw00 at 2010-06-24 16:27:30:
我的晶格是26.32。文献数据26.02
1。不知道，根据他拟合的力场参数建的新的力场文件。H2的模型和力场参数的影响有多大？怎么影响？谢谢解释下
2。77k，FH量子效应怎么考虑进去？！
3。excess。另一个结构两个数 ...

1、H2的模型和参数对于结果影响有多大，这个跟体系有关，有的体系是几种模型差不多，有的体系是三原子模型最好。但是计算速度最慢。
2、77K，一般情况下可以不考虑FH量子效应，不过当你计算结果不好时，就需要加了，Cerius我没有用过，不过按照Sorption来看，是没法计算FH量子效应的，这个是需要编程计算的。
3，一般和文献上结果比较的时候，都需要转换为excess，这个是普遍的。
4，这个没用过，不说。
5，不管压力多小，用逸度总是没错的。
6，H2三原子模型就是考虑H2在低温时很弱的极距，会在两个H原子之间添加一个虚原子，虚原子带正电荷，H带负电荷，这种情况下MOF-5上的原子就需要分配电荷了，如果你没有采用这种H2模型，就不用给MOF-5分配电荷。
总之，在达到同样效果的时候，模型自然是越简单越好，同时，由于吸附量比较大，计算的步数不能太少，最少得500W起步吧。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-06-24 16:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-24 16:59:03:

1、H2的模型和参数对于结果影响有多大，这个跟体系有关，有的体系是几种模型差不多，有的体系是三原子模型最好。但是计算速度最慢。
2、77K，一般情况下可以不考虑FH量子效应，不过当你计算结果不好时，就需要 ...

Buch力场参数，Cracknell力场参数是什么参数？他和MS中的dreiding力场参数有什么区别？！
forcite优化的时候，原文献也选的是dreiding力场，怎么结果差距会这么大？他的晶格26.025 我的26.317  实验数据25.832 ？
赞一下 回复此楼
8楼2010-06-24 17:08:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-06-25 11:22:04
引用回帖:
Originally posted by rdw00 at 2010-06-24 17:08:47:



Buch力场参数，Cracknell力场参数是什么参数？他和MS中的dreiding力场参数有什么区别？！
forcite优化的时候，原文献也选的是dreiding力场，怎么结果差距会这么大？他的晶格26.025 我的26.317  实验数据25 ...

Buch和Cracknell的参数很多文献都在用，你多看文献就知道了，一般都是用它们计算H2的，Dreiding里的H的参数，似乎用来描述H2不合适，所以很少有人采用，Dreiding里的H的参数和Buch他们的参数有区别。Forcite优化似乎不改变晶胞的参数，我记得只改变原子的坐标。我记得MOF-5的晶体文件下载下来就是25.832。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2010-06-24 17:13:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rdw00

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-06-24 17:13:16:

Buch和Cracknell的参数很多文献都在用，你多看文献就知道了，一般都是用它们计算H2的，Dreiding里的H的参数，似乎用来描述H2不合适，所以很少有人采用，Dreiding里的H的参数和Buch他们的参数有区别。Forcite优化 ...

我吸附的时候用的文献给的参数，描述了H2中的H的相关力场参数。
forcite选择优化几何结构优化的时候，有个more选项，里面有个optimize cell 这个选项，勾上就可以优化晶胞参数
赞一下 回复此楼
10楼2010-06-24 17:22:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 rdw00 的主题更新
251/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 14:24 by jCd0dEvKHShX
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 14:15 by jCd0dEvKHShX
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 13:51 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 13:41 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +14 晴天加油 2026-08-26 15/750 2026-08-29 11:06 by biily
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 10:18 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭