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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】郁闷
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whjhx

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】郁闷 已有3人参与

好不容易分离了一株细菌，测序后，将序列BLAST居然发现和我以前分离的一株细菌是同一个种，但序列有所不同，请问这个序列还能上传到GeneBank吗？以前那株细菌已发表过文章，请问现在这株还可以发表文章吗？如果不能，心有不甘啊，因为花了不少功夫。

[ Last edited by whjhx on 2010-6-21 at 23:07 ]
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1楼 2010-06-21 22:56:32
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reasonspare

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):热心斑斑，谢谢交流。 2010-06-22 08:27:23
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2010-06-21 23:05:04:
种的鉴定花了我大量功夫，所以不能发文章觉得可惜了。

不知道你测的那个基因，去blast
如果说16S rDNA， 即使在99.3%（有人说是 99.9%） 的相似性水平也可以是不同的种。

16s只能确定属水平。

另外如果你做的ITS，可能到亚属水平或者种水平，但是既然你熟练与种的鉴定，如果你有足够的证明它与其他已知种不同就可以了，或者新种，或者新生态型。
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大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
4楼2010-06-22 04:19:03
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-06-22 04:14:37
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2010-06-21 22:56:32:
好不容易分离了一株细菌，测序后，将序列BLAST居然发现和我以前分离的一株细菌是同一个种，但序列有所不同，以前那株细菌已发表过文章，请问现在这株还可以发表文章吗？如果不能，心有不甘啊，因为花了不少功夫。

不一定要靠新的种发文章啊，其他角度呢
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小木虫之有关部门负责人
2楼2010-06-21 23:00:51
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whjhx

金虫 (正式写手)
种的鉴定花了我大量功夫，所以不能发文章觉得可惜了。
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3楼2010-06-21 23:05:04
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whjhx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by reasonspare at 2010-06-22 04:19:03:


不知道你测的那个基因，去blast
如果说16S rDNA， 即使在99.3%（有人说是 99.9%） 的相似性水平也可以是不同的种。

16s只能确定属水平。

另外如果你做的ITS，可能到亚属水平或者种水平，但是既然你熟练 ...

我测的是16S rRNA，不知道和16S rDNA有无区别？
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5楼2010-06-22 08:36:45
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