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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】如何根据势能曲线拟合力场参数
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何根据势能曲线拟合力场参数 已有8人参与

下图是Au-Au的Dimer二聚体的解离曲线


势能曲线有了，现在需要拟合下面三个公式里的多个参数，具体该怎么做？有直接能用的软件吗？请大家帮忙
E=E1+E2+E3


参数a,b,c,d,e,f


参数p,q,s


参数g,h,i,j,k,m


谢谢帮忙！！！

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-6-12 at 21:31 ]
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1楼 2010-06-12 21:26:55
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zyj8119

木虫 (著名写手)
function [a1,b1,a2,b2]=forcefieldfitting(r,e)
        %使用DFT计算的数据拟合力场参数,e是使用量化计算出现的相互作用能，r是两个分子片段之间的距离
        %LJ-12-06公式中的EPSILON(C):a1
        %LJ-12-06公式中的SIGMA(C):b1
        %LJ-12-06公式中的EPSILON(O):a2
        %LJ-12-06公式中的SIGMA(O):b2
        %单个的CO2的能量可以认为是两个O的能量和一个C的能量的加和
       if(length(e)==length(r))
           n=length(e);
       else
           disp('e和r的维数不相等！');
           return;
       end                %维数检查
        A=zeros(4,3)
        B=zeros(4,2);
        for i=1:n
            A(1,1)=A(1,1)+(384*a1^2*b1^23)/r(i)^24;
            A(1,2)=A(1,2)+(192*a1^2*b1^11)/r(i)^12;
            A(1,3)=A(1,3)+(48*a1*e*b1^5)/r(i)^6;
            A(2,1)=A(2,1)+(32*a1*b1^24)/r(i)^24;
            A(2,2)=A(2,2)+(32*a1*b1^12)/r(i)^12
            A(2,3)=A(2,3)+(8*e(i)*b1^6)/r(i)^6;
            A(3,1)=A(3,1)+(1536*a2^2*b2^23)/r(i)^24;
            A(3,2)=A(3,2)+(768*a2^2*b2^23)/r(i)^12;
            A(3,3)=A(3,3)+(96*a2*e(i)*b2^5)/r(i)^6;
            A(4,1)=A(4,1)+(128*a2*b2^24)/r(i)^24;
            A(4,2)=A(4,2)+(128*a2*b2^12)/r(i)^12;
            A(4,3)=A(4,3)+(16*e(i)*b2^6)/r(i)^6;
            B(1,1)=B(1,1)+(576*a1^2*b1^17)/r(i)^18;
            B(1,2)=B(1,2)+(96*a1*e(i)*b1^11)/r(i)^12;
            B(2,1)=B(2,1)+(64*a1*b1^18)/r(i)^18;
            B(2,2)=B(2,2)+(8*e(i)*a1^12)/r(i)^12;
            B(3,1)=B(3,1)+(2304*a2^2*b2^17)/r(i)^18;
            B(3,2)=B(3,2)+(192*a2*e(i)*b2^11)/r(i)^12;
            B(4,1)=B(4,1)+(256*a2*b2^18)/r(i)^18;
            B(4,3)=B(4,3)+(16*e(i)*b2^12)/r(i)^12;
        end
        s=A\B;
        a1=s(1);
        b1=s(2);
        a2=s(3);
        b2=s(4);
我这个预先设置UFF的参数，然后这么拟合出来的，不知道行不行？
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好好学习，天天向上。
5楼2010-06-12 22:32:50
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zyj8119

木虫 (著名写手)
xiaowu787(金币+1): 2010-06-13 09:32:30
这个也许得编程，我也同问高人。。
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好好学习，天天向上。
2楼2010-06-12 21:39:48
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:32:47
xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:34:02
lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-13 09:36:58
xiaowu787(金币+3):Thanks 2010-06-13 10:30:42
非线性拟合问题, 很多现成软件可以做, 推荐1stOpt
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=12576
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3楼2010-06-12 21:56:19
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
雪狼乖乖(金币+5):感谢您的参与 2010-06-15 07:46:37
雪狼乖乖(金币+5):感谢您的参与 2010-06-15 07:47:00
雪狼乖乖(金币+2, 模拟EPI+1):您的计算平台是不是MATLAB？您的算法收敛否？精度如何？能否给予说明？ 2010-06-15 07:52:35
不知道GULP能做这个不？
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好好学习，天天向上。
4楼2010-06-12 22:27:17
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