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xiaowu787木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】如何根据势能曲线拟合力场参数 已有8人参与
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下图是Au-Au的Dimer二聚体的解离曲线 势能曲线有了，现在需要拟合下面三个公式里的多个参数，具体该怎么做？有直接能用的软件吗？请大家帮忙 E=E1+E2+E3  参数a,b,c,d,e,f  参数p,q,s  参数g,h,i,j,k,m 谢谢帮忙！！！ [ Last edited by xiaowu787 on 2010-6-12 at 21:31 ] |
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 动力学强帖 | 气态分子化学动力学 |
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function [a1,b1,a2,b2]=forcefieldfitting(r,e) %使用DFT计算的数据拟合力场参数,e是使用量化计算出现的相互作用能，r是两个分子片段之间的距离 %LJ-12-06公式中的EPSILON(C):a1 %LJ-12-06公式中的SIGMA(C):b1 %LJ-12-06公式中的EPSILON(O):a2 %LJ-12-06公式中的SIGMA(O):b2 %单个的CO2的能量可以认为是两个O的能量和一个C的能量的加和 if(length(e)==length(r)) n=length(e); else disp('e和r的维数不相等！'); return; end %维数检查 A=zeros(4,3) B=zeros(4,2); for i=1:n A(1,1)=A(1,1)+(384*a1^2*b1^23)/r(i)^24; A(1,2)=A(1,2)+(192*a1^2*b1^11)/r(i)^12; A(1,3)=A(1,3)+(48*a1*e*b1^5)/r(i)^6; A(2,1)=A(2,1)+(32*a1*b1^24)/r(i)^24; A(2,2)=A(2,2)+(32*a1*b1^12)/r(i)^12 A(2,3)=A(2,3)+(8*e(i)*b1^6)/r(i)^6; A(3,1)=A(3,1)+(1536*a2^2*b2^23)/r(i)^24; A(3,2)=A(3,2)+(768*a2^2*b2^23)/r(i)^12; A(3,3)=A(3,3)+(96*a2*e(i)*b2^5)/r(i)^6; A(4,1)=A(4,1)+(128*a2*b2^24)/r(i)^24; A(4,2)=A(4,2)+(128*a2*b2^12)/r(i)^12; A(4,3)=A(4,3)+(16*e(i)*b2^6)/r(i)^6; B(1,1)=B(1,1)+(576*a1^2*b1^17)/r(i)^18; B(1,2)=B(1,2)+(96*a1*e(i)*b1^11)/r(i)^12; B(2,1)=B(2,1)+(64*a1*b1^18)/r(i)^18; B(2,2)=B(2,2)+(8*e(i)*a1^12)/r(i)^12; B(3,1)=B(3,1)+(2304*a2^2*b2^17)/r(i)^18; B(3,2)=B(3,2)+(192*a2*e(i)*b2^11)/r(i)^12; B(4,1)=B(4,1)+(256*a2*b2^18)/r(i)^18; B(4,3)=B(4,3)+(16*e(i)*b2^12)/r(i)^12; end s=A\B; a1=s(1); b1=s(2); a2=s(3); b2=s(4); 我这个预先设置UFF的参数，然后这么拟合出来的，不知道行不行？ |
5楼2010-06-12 22:32:50
2楼2010-06-12 21:39:48
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
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- 金币: 2332.8
- 红花: 1
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- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
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xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:32:47
xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:34:02
lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-13 09:36:58
xiaowu787(金币+3):Thanks 2010-06-13 10:30:42
xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:32:47
xiaowu787(金币+3): 2010-06-13 09:34:02
lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-13 09:36:58
xiaowu787(金币+3):Thanks 2010-06-13 10:30:42
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非线性拟合问题, 很多现成软件可以做, 推荐1stOpt http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=12576 |
3楼2010-06-12 21:56:19
4楼2010-06-12 22:27:17
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