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【求助/交流】序列比对中的问题
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sunhongjuan
铁虫
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专业: 生物化学
[交流]
【求助/交流】序列比对中的问题
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我在对20种灰霉菌的ITS序列进行比对后,为什么开头部分和结尾部分有很多序列不能配对,请大家指教这是什么原因造成的?
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1楼
2010-06-06 20:34:09
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sunhongjuan
铁虫
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虫号: 1013163
注册: 2010-05-07
专业: 生物化学
谢谢您的帮助,使我理清了思路来解决这一问题
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6楼
2010-06-07 19:49:27
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gaiyf
金虫
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专业: 环境微生物学
★ ★ ★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):最近很活跃。 2010-06-06 21:01:49
那时侧序的问题,一般的测序在开始和最后几个碱基都是不是很准确的,不过这是不用担心的,不会影响到后面的检测
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多看文献,多学知识
2楼
2010-06-06 20:38:09
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sunhongjuan
铁虫
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虫号: 1013163
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专业: 生物化学
再次请教
谢谢楼上了。想再请教一下,这种结果有没有可能是种内的变异造成的
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3楼
2010-06-07 09:22:08
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xiadongliang
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虫号: 433819
注册: 2007-08-18
性别: GG
专业: 环境微生物学
一般开始的部分序列肯定是不准确的,无法用来做研究的。但是如果你是将序列构建克隆后测序,那就很准确了。
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4楼
2010-06-07 14:41:47
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