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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌鉴定
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hunter3401

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】细菌鉴定 已有3人参与

请问各位虫友！我的一株菌做的生理生化鉴定为少动鞘氨醇单胞菌，后来做16s，结果和克雷伯氏菌有96%的相似性和大肠杆菌有94%的相似性。该菌菌落形态有两种，一种菌落较小圆湿，另一种为白干，中间凸起，边缘不齐整。镜检图片见附件。是不是菌种不纯？还是生理生化鉴定错了？还是16s错了？大家给个建议谢谢！
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1楼 2010-06-02 18:54:14
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kechong

木虫 (正式写手)
同意楼上的观点，根据楼主的说明的情况，肯定是菌种不纯，先分纯一下
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3楼2010-06-29 09:47:39
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kerry2011

新虫 (初入文坛)
★
hunter3401(金币+2): 2010-06-11 22:06:54
lmzxcom1(金币+1):回答的很不错！鼓励一下 2010-06-29 19:34:28
首先，我认为是菌种不纯，我建议把不同的菌落形态的菌单菌落平板划线纯化多次，菌落形态一致后再分别测16S验证。
其次，单单通过生理生化指标来鉴定菌种是远远不足的。
最后，目前最可靠的菌种鉴定方法是16S序列比对，序列相似性低于97%，说明是新细菌。高于97%，就要做DNA杂交，杂交率低于70%也说明是新菌株，高于70%则是同一株菌的不同菌株。
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2楼2010-06-11 11:15:09
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
问题：菌种不纯，在做16S的时候怎么会得到好的测序结果呢？
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4楼2010-06-29 12:28:51
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