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guojing0000

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】紧急求助关于单细胞凝胶电泳实验 已有11人参与

我最近在做彗星实验,但是很奇怪的是实验过程中不知道存在什么问题,跑完电泳后就看不到细胞了,视野是一片漆黑啊,呜呜呜,很伤心,希望大家给我找找原因。
具体的实验方法如下:
2.1电泳胶板的制作
移液枪吸取10μL 1%正常熔点琼脂糖,至4℃冷却。待胶凝固(15min)后取出,置于冰上面。然后吸取150μL0. 5%正常熔点琼脂糖,待胶稍微凝固加上洁净的盖玻片,至至4℃冷却。待胶凝固(15min)后取出。之后用手指肚缓慢滑去盖玻片。吸取25μL细胞悬浮液与75μL低熔点琼脂糖混和,迅速将细胞混合液滴到第一层胶上,加盖玻片让其均匀铺开,置4℃15min,使琼脂固化。
2.2细胞裂解
    移开盖玻片,将载玻片浸入新配制的4℃裂解液中,在4℃冰箱中放置至少1h,但时间不能过长,长时间的裂解可能导致裂解液沉淀。
2.3 DNA解旋
    轻轻移去盖玻片后将载玻片水平并列置于电泳槽阳极端,电泳槽中盛有新配制碱性电泳缓冲液,约覆过载玻片2.5mm,放置30min。
2.4电泳
    调整电泳槽中缓冲液面高度,使电泳仪的电压为25V(恒压),电流为300mA,电泳20min。
2.5中和、染色
    电泳结束后取出玻片用蒸馏水冲洗3次,并用滤纸吸去多余的水分,放小瓷盘,沿器壁加入0.4mol•L-1Tris-HCl(pH=7.5)缓冲液,中和3次,每次5分钟,中间更换中和液。
2.6观察和分析:
    各组载玻片加入染色剂染色5min后,用荧光显微镜观察,用随机软件在自动曝光条件下拍照获取彗星图像后,用CASP软件分析测量DNA迁移的各种参数。
3.        实验试剂配制方法
试剂的配置:
正常熔点的琼脂(normal melting agarose);低熔点的琼脂(low melting agarose);Tris;肌氨酸钠(Sodium sarcosinate);Triton X-100;DMSO(dimethyl sulfoxide;二甲基亚砜); EB(ethidium bromide);NaCl;Na2EDTA;EDTA;NaOH;KCl;Na2HPO4;KH2PO4;乙醇
1%正常熔点的琼脂(无Ca2+、Mg2+的PBS配制):
    配 10ml   需琼脂为:0.1g,称量完放入水浴锅,使水浴锅温度不断上升至95摄氏度,观察到澄清透明时方可。
0.5%正常熔点的琼脂(无Ca2+、Mg2+的PBS配制):
    配 5ml   需琼脂为:0.05g,称量完放入水浴锅,使水浴锅温度不断上升至95摄氏度,观察到澄清透明时方可。
0.7%低熔点的琼脂(无Ca2+、Mg2+的PBS配制):
    配 10ml   需琼脂为:0.7g,称量完放入水浴锅,使水浴锅温度不断上升至37摄氏度,观察到澄清透明时方可。
细胞裂解液(4℃):
    2.5M NaCl;100mM Na2EDTA;10mM Tris;调pH至10;1%肌氨酸钠;临用前加1% Triton X-100,10% DMSO
配500ml 需:NaCl 73.05g;Na2EDTA 18.61g;Tris 0.61g;肌氨酸钠5g;Triton X-100 5ml;DMSO 50ml,NaOH 4g
配制方法:先用300ml灭菌水溶解NaOH 4g,然后加入肌氨酸钠,用磁力搅拌加热溶解,然后再加入其它物质。临用前1小时加入1% Triton X-100,10% DMSO,磁力搅拌无固体后,放入4摄氏度冰箱。
电泳缓冲液:
    1mM Na2EDTA和300mM NaOH,调pH>13,现用现配。
pH 7.5,0.4M Tris:
    配100ml需Tris为:4.8456g,加尽量少的水溶解,用HCl调节pH=7.5
碘化丙锭PI水溶液:2mg/l EB染色剂(4℃暗处保存)

需要补充一句的是,我的PI是去年1月份配置的,放置到现在采用,请问可以吗?配置时的浓度是100mg/l的,现在每次使用前稀释。
希望大家知无不言,言无不尽啊,我实在是找不到原因了啊
谢谢各位大虾啦!
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我是凉快

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by guojing0000 at 2010-11-24 22:41:48
我的问题已经解决了,是PH的问题
我们还好啦,第一层胶铺大点,用专用的磨砂玻片,脱胶还好啦...

你好啊,我也遇到了你这种情况QAQ,我想请问一下你是哪一步的ph出现问题了呢?
12楼2017-01-01 15:01:51
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angel619

新虫 (初入文坛)

彗星实验


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
如果细胞没有应该可能是你把细胞稀释的太少了,我们做这个实验也是,细胞多了不是,少了也不是,但是我们现在老是脱胶,请问你们的容易脱胶吗?
2楼2010-11-24 09:48:16
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guojing0000

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by angel619 at 2010-11-24 09:48:16:
如果细胞没有应该可能是你把细胞稀释的太少了,我们做这个实验也是,细胞多了不是,少了也不是,但是我们现在老是脱胶,请问你们的容易脱胶吗?

我的问题已经解决了,是PH的问题
我们还好啦,第一层胶铺大点,用专用的磨砂玻片,脱胶还好啦
3楼2010-11-24 22:41:48
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laq3389797

银虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
你的细胞是怎么分离的啊?我用的机械法和酶法,效果都不怎么好。
而且我不知道怎么检测细胞核时候从根尖上脱落下来了。
我做的是大豆根尖细胞,太脑壳痛了啊!!!
NeverUnderestiamatetheheartofachampion
4楼2011-08-02 15:30:01
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