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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】有机分子模拟
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yunny

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有机分子模拟 已有7人参与

想知道几个有机物分子的三维尺寸，但对模拟一窍不通，请哪位大侠帮忙计算，或是告知具体操作，非常感谢！

以下是方程式：
需要计算 1）反应物-对甲氧基苯酚 2）产物-第二个和第三个 3）图中未画出，就是反应物1上羟基的H换成叔丁基


恳请哪位大侠帮帮忙！
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1楼 2010-06-01 10:02:12
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nh13

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-06-12 20:20:00
在Chemdraw中画出二维结构，然后用Chemoffice中的Chem3D打开，即可得到3维结构，之后用Chem3D中的calculation中的MM2力场优化一下。粗略估计应该够了。如果需要精确计算构型可以用calculation中的Gamess，Gaussian等选项优化一下。
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8楼2010-06-12 16:41:58
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traveler1985

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帮顶，等待高人回帖！
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2楼2010-06-02 10:42:00
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wujiangjie

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-03 08:27:16
楼主，你可以用MS或别的软件将这个分子画出来，然后将其优化，使其结构合理后再具体测量一下就可以了，挺简单的，你试试
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4楼2010-06-02 21:51:08
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-03 08:27:23
在本版下载个sybyl-X就行，优化一下，应该很容易的
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从小到大就没清闲过，要不就是穷，穷的活着没意思，要不就是累，累得活着没意思，现在是又穷又累了
5楼2010-06-03 01:27:42
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