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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯09的内存控制方式是不是得到改进了？
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 【求助】高斯09的内存控制方式是不是得到改进了？ 已有7人参与

我们刚用上高斯09没几天。今天我师弟提交了一个任务，设定%mem=5gb。运行到L502的时候，却意外发现top显示的内存占用率仅为4.7%（换算过来，大约是0.75gb）。
是不是高斯09的内存控制更加聪明了？不再像G03那样，给它多少他都独霸着；而是根据需要取用。
really？

附：我用的版本是 EM64L-Gaussian09 Rev A.01 for Linux/UNIX

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-5-25 at 14:34 ]
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1楼 2010-05-25 14:28:55
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
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heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-05-25 15:55:15
好的内存阿
资源真好
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2010-05-25 15:37:29
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gyli

木虫 (小有名气)

~~~~
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用不着那么多吧

我经常遇到此情况
赞一下(1人) 回复此楼
Gravitation cannot be held responsible for people falling in love.
3楼2010-05-25 17:08:42
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
好像G03也是这样吧
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技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
4楼2010-05-25 19:01:59
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Miracle922

铜虫 (正式写手)
到还没注意到
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做到极致，做到细处
5楼2010-05-25 19:02:31
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢讨论 2010-05-27 18:34:38
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2010-05-25 14:28:55:
我们刚用上高斯09没几天。今天我师弟提交了一个任务，设定%mem=5gb。运行到L502的时候，却意外发现top显示的内存占用率仅为4.7%（换算过来，大约是0.75gb）。
是不是高斯09的内存控制更加聪明了？不再像G03那样， ...

这种内存管理模式对小分子的计算会快很多，
但是如果算很大的分子，这种内存管理模式在频率计算部分是一种灾难
会出现没完没了的产生vectors情况
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
6楼2010-05-25 19:52:57
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九层楼

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2010-05-25 19:52:57:


这种内存管理模式对小分子的计算会快很多，
但是如果算很大的分子，这种内存管理模式在频率计算部分是一种灾难
会出现没完没了的产生vectors情况

谢谢分享，学习了

能否简单评论下原因？而且、有解决的办法么？
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7楼2010-05-25 21:35:02
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2010-05-25 19:52:57:


这种内存管理模式对小分子的计算会快很多，
但是如果算很大的分子，这种内存管理模式在频率计算部分是一种灾难
会出现没完没了的产生vectors情况

也还好吧，hairan老师。我发现到了执行freq计算的时候，就自动把内存占满了。高斯似乎更聪明了
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8楼2010-05-26 09:11:45
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★
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aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-05-27 18:34:45
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2010-05-26 09:11:45:

也还好吧，hairan老师。我发现到了执行freq计算的时候，就自动把内存占满了。高斯似乎更聪明了

我说的是很大很大的分子，baisis functions超过3000的那种
我有个体系算下来3800多个basis functions
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
9楼2010-05-26 18:30:33
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢讨论 2010-05-27 18:34:51
引用回帖:
Originally posted by 九层楼 at 2010-05-25 21:35:02:


谢谢分享，学习了

能否简单评论下原因？而且、有解决的办法么？

用Gaussian09没什么有效的办法，我写信问过gaussian客服，他们也没有解决
不过我发现可以使用那种通用版本的Gaussian03来计算，可以算过去。
（就是采用开始小卒说的那种内存管理模式的Gaussian03版本，而不是客户用源代码自己编译的那种，自己编译的版本一般内存管理起来类似Gaussian09）
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
10楼2010-05-26 18:43:58
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