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【求助/交流】MEGA 画系统发育树中的bootstrap values和Identity scores有什么区别?已有20人参与
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| MEGA 系统发育分析中,在图上标的值是bootstrap values,这是什么意思,而在文章中我看许多都是对Identity scores进行分析,这两个值有什么区别呀,希望大家回复! |
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6楼2010-05-18 11:19:31
ottolzm
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+3):很详细~~~ 2010-05-17 21:02:35
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+3):很详细~~~ 2010-05-17 21:02:35
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Bootstrap values (步长值)是指在你选择的遗传距离算法(一般选择邻接法即N-J法)中软件根据所比对序列得到结果 比如 bootstrap value设置为1000,即软件构建了相应的1000”棵树“,在每个节点上显示的bootstrap value 即指在这1000次建树过程中,有相应的次数的频率这个分枝内的几株菌或几段序列在进化速度上相似,一般认为节点处的bootstrap value大于500时分析结果可信,bootstrap value 在mega ,philiphy,等软件中常见,而在SAS等软件中,简述过程相对麻烦但是 最终显示的是Identity scores 即遗传距离,或者指进化距离,同样表示了待分析菌或序列的进化关系的远近。 不知道这样说你能否理解 呵呵 两者是一样的 很多文献两者都认可(只要你的分析是正确的就行) |
2楼2010-05-17 21:01:49
exon2002
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3楼2010-05-18 07:31:21
exon2002
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