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小鱼儿1703

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xiaoboxia at 2010-05-10 08:04:21:
我帮你看看,但是不一定能出现相同的问题

据目前所知,是初始结构问题,我在调整一下,看会不会好一点
11楼2010-05-10 10:01:55
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cxc521

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
苯环本来就不是我们通常画的单双键交替,它的六个H是等同的 所以化成中间是圈的更合理些 个人愚见
12楼2010-05-10 10:06:44
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小鱼儿1703

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by cxc521 at 2010-05-10 10:06:44:
苯环本来就不是我们通常画的单双键交替,它的六个H是等同的 所以化成中间是圈的更合理些 个人愚见

上面的6个键是等同的啊,是直接 调用的。应该没问题吧……
13楼2010-05-10 10:15:38
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caohuiming

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
单键变成双键;苯环变得不成样子了,哪还是苯环啊!完全不是以前的分子结构了……
看了楼主这句我是在很想笑   看到优化后的惨像  楼主被吓到了吗   真的勇士敢于直面惨淡的结构  别怕   这是黄酮类的结构  又是自由基    楼主是想研究抗氧化活性还是看肿瘤活性   我刚好做过这方面的计算   在没给出具体结构的情况下  我通过你发的分子照片很难想想你的苯环变成啥了   难道成了环己烷的椅式了吗   我看没有吗   你要是自己觉得不合适  可以先用半经验预优化   那样最初构象看起来就赏心悦目的多了
14楼2010-05-10 18:06:39
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小鱼儿1703

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by caohuiming at 2010-05-10 18:06:39:
单键变成双键;苯环变得不成样子了,哪还是苯环啊!完全不是以前的分子结构了……
看了楼主这句我是在很想笑   看到优化后的惨像  楼主被吓到了吗   真的勇士敢于直面惨淡的结构  别怕   这是黄酮类的结构  又是 ...

碰到知音了,在下做的就是黄酮的抗氧化活性,算O-H离解焓。算的时候也经常中断,你的黄酮分子是在一个平面上算的吗?
15楼2010-05-10 19:24:01
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
键是单是双没关系。可能你初始结构给的不好,所以歪曲了。你用什么方法优化的?
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
16楼2010-05-11 10:23:12
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小鱼儿1703

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2010-05-11 10:23:12:
键是单是双没关系。可能你初始结构给的不好,所以歪曲了。你用什么方法优化的?

*********************************************
%chk=er cha su.chk
%mem=200MB
%nproc=1
Will use up to    1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=2000MB
----------------------------
# ub3lyp/6-31g(d,p) opt freq
----------------------------
17楼2010-05-11 12:02:14
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