【求助】优化后…… - 量子化学 - Gaussian - 第2页小木虫论坛-学术科研互动平台

11楼2010-05-10 10:01:55

cxc521

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苯环本来就不是我们通常画的单双键交替，它的六个H是等同的所以化成中间是圈的更合理些个人愚见

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12楼2010-05-10 10:06:44

小鱼儿1703

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引用回帖:

Originally posted by cxc521 at 2010-05-10 10:06:44:
苯环本来就不是我们通常画的单双键交替，它的六个H是等同的所以化成中间是圈的更合理些个人愚见

上面的6个键是等同的啊，是直接调用的。应该没问题吧……

13楼2010-05-10 10:15:38

caohuiming

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单键变成双键；苯环变得不成样子了，哪还是苯环啊！完全不是以前的分子结构了……
看了楼主这句我是在很想笑看到优化后的惨像楼主被吓到了吗真的勇士敢于直面惨淡的结构别怕这是黄酮类的结构又是自由基楼主是想研究抗氧化活性还是看肿瘤活性我刚好做过这方面的计算在没给出具体结构的情况下我通过你发的分子照片很难想想你的苯环变成啥了难道成了环己烷的椅式了吗我看没有吗你要是自己觉得不合适可以先用半经验预优化那样最初构象看起来就赏心悦目的多了

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14楼2010-05-10 18:06:39

小鱼儿1703

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引用回帖:

Originally posted by caohuiming at 2010-05-10 18:06:39:
单键变成双键；苯环变得不成样子了，哪还是苯环啊！完全不是以前的分子结构了……
看了楼主这句我是在很想笑看到优化后的惨像楼主被吓到了吗真的勇士敢于直面惨淡的结构别怕这是黄酮类的结构又是 ...

碰到知音了，在下做的就是黄酮的抗氧化活性，算O-H离解焓。算的时候也经常中断，你的黄酮分子是在一个平面上算的吗?

15楼2010-05-10 19:24:01

yyx19840628

木虫 (著名写手)

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键是单是双没关系。可能你初始结构给的不好，所以歪曲了。你用什么方法优化的？

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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……

16楼2010-05-11 10:23:12

小鱼儿1703

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引用回帖:

Originally posted by yyx19840628 at 2010-05-11 10:23:12:
键是单是双没关系。可能你初始结构给的不好，所以歪曲了。你用什么方法优化的？

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%chk=er cha su.chk
%mem=200MB
%nproc=1
Will use up to 1 processors via shared memory.
Default route: MaxDisk=2000MB
----------------------------
# ub3lyp/6-31g(d,p) opt freq
----------------------------

17楼2010-05-11 12:02:14