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Choke银虫 (小有名气)
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【求助】如何设定带分数电荷的H，用于钝化表面的悬挂键 已有4人参与
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(a)在做表面H钝化时，文章里提到需要用带分数电荷的H，以防止引入新的表面态（如图中红线所示）。请问这个功能在MS中能够实现吗？我看到properties里面有formalcharge这一项，是不是就在这里面设定所需要的分数电荷？帮助文件里对formal charge的定义是：Formal charge is a theoretical number assigned to an atom on the basis that all bonds in a molecule are purely covalent. This means that each atom in the bonding pair is assigned one electron from the bond. 我对文中的理解，以用2/3H对O进行钝化为例，O在SnO2中有3个键，要保持这种结构，也需要用3个H来钝化，并保持O总共得到2个电子以达到complete shell，这样每个H应贡献2/3个电子。2/3H把所有的电子都贡献给O了，变成了对electronic structure没有影响的质子。请问这样理解是否正确？如果是这样的话那改formal charge就不对了，因为它以pure covalent为基础的。那如何构建这样一个只带2/3个电荷的H原子呢？  文章链接如下 http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z (b) 用H钝化之后，文中把H-O,H-Sn键的键长都固定了，请问在MS做结构优化时能只固定这些bond length吗？ http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z |
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