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Choke银虫 (小有名气)
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【求助】如何设定带分数电荷的H,用于钝化表面的悬挂键 已有4人参与
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(a)在做表面H钝化时,文章里提到需要用带分数电荷的H,以防止引入新的表面态(如图中红线所示)。请问这个功能在MS中能够实现吗?我看到properties里面有formalcharge这一项,是不是就在这里面设定所需要的分数电荷?帮助文件里对formal charge的定义是:Formal charge is a theoretical number assigned to an atom on the basis that all bonds in a molecule are purely covalent. This means that each atom in the bonding pair is assigned one electron from the bond. 我对文中的理解,以用2/3H对O进行钝化为例,O在SnO2中有3个键,要保持这种结构,也需要用3个H来钝化,并保持O总共得到2个电子以达到complete shell,这样每个H应贡献2/3个电子。2/3H把所有的电子都贡献给O了,变成了对electronic structure没有影响的质子。请问这样理解是否正确?如果是这样的话那改formal charge就不对了,因为它以pure covalent为基础的。那如何构建这样一个只带2/3个电荷的H原子呢? ![]() 文章链接如下 http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z (b) 用H钝化之后,文中把H-O,H-Sn键的键长都固定了,请问在MS做结构优化时能只固定这些bond length吗? http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z |
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11楼2023-06-07 09:34:26
valenhou001
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