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yeedro

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】向各位大虾请教“易错PCR” 已有4人参与

第一次做“易错PCR”,问题可能有些幼稚,请别见笑。
主要是,在做镁离子调节时,以怎么个梯度来进行比较好呢?0.5mmol逐渐增加,还是怎样呢?
关于这种PCR方法,大家有什么好的建议吗?最需要注意什么呢?
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rkrl001

木虫 (正式写手)


lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-05-06 12:20:40
yeedro(金币+1): 2010-05-06 14:46:48
易错PCR?第一次听说。Mg2+浓度一般2.0或者2.5足以满足,不是PCR的决定因素,最重要的是模板质量和引物。
3楼2010-05-06 12:14:31
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查看全部 5 个回答

姜大磊

木虫 (小有名气)


1949stone(金币+1):有道理 2010-05-06 12:28:50
yeedro(金币+1): 2010-05-06 14:46:42
yeedro(金币+13): 2010-05-15 00:07:52
不知道你做的是什么因子的啊,为什么要调节镁离子啊,我也是做这个的,没遇到你这种情况啊,先自己把实验的“精神”弄清楚,然后再开始,这样能避免走弯路。
Nevergiveup,neverslowdown;Nevergrowold,nevereverdieyoung......
2楼2010-05-06 12:02:36
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默默chh

金虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-21 11:42:46
我也做易错啊!文献中大多用镁离子为7mM的,0.5mM递增太小了啊,最起码1吧。
happy
4楼2011-04-21 10:48:45
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by rkrl001 at 2010-05-06 12:14:31:
易错PCR?第一次听说。Mg2+浓度一般2.0或者2.5足以满足,不是PCR的决定因素,最重要的是模板质量和引物。

我了解也不多,google了下,嘿嘿~

http://bbs.bbioo.com/thread-56842-1-1.html
易错PCR是在采用DNA聚合酶进行目的基因扩增时,通过调整反应条件,
如提高镁离子浓度、加入锰离子、改变体系中四种的dNTPs浓度或运用低保真度
DNA聚合酶等,来改变扩增过程中的突变频率,从而以一定的频率向目的基因中随
机引入突变,获得蛋白质分子的随机突变体。其关键在于对合适突变频率的选择,
突变频率太高会导致绝大多数突变为有害突变,无法筛选到有益突变;突变频率太
低则会导致文库中全是野生型群体。理想的碱基置换率和易错的最佳条件主要依赖
于突变的DNA片段的长度。通常,经一次突变的基因很难获得满意的结果,由此
发展出连续易错  PCR(sequentialermr-PronePCR)策略。即将一次扩增得到的有益突
变基因作为下一次扩增的模板,连续反复地进行随机诱变,使每一次扩增得到的正
向突变累积而产生重要的有益突变。由于易错PCR涉及的遗传变化只发生在单一
分子内部,故属于无性进化 (asexualevolution)。它虽然可以有效的产生突变,且操
作方法简单,但其一般只适用较小的基因片段,且突变碱基中转换高于颠换,应用
范围较为有限。
5楼2011-04-21 11:50:56
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