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xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】目的基因在mRNA中的位置 已有8人参与

想请教一下,我现在已经从NCBI上获得了mRNA的序列,如何找到我的目的基因在mRNA中的具体位置?谢谢!
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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

不是很明白你所指的具体位置是什么意思?
2楼2010-04-28 10:48:59
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xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

目的基因在mRNA中的位置

★
1949stone(金币+1): 2010-04-28 14:48
1949stone:解释一下好 2010-04-28 14:48
我是提取的动物组织的总mRNA,mRNA有28S, 18S, 5S三条带,我的目的条带应该是在哪条带的位置。这个能看得出来吗,或者通过什么方式能查到?
3楼2010-04-28 10:53:22
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★
amisking(金币+2): 2010-04-28 13:28
引用回帖:
Originally posted by xuejinyz1 at 2010-04-28 10:53:22:
我是提取的动物组织的总mRNA,mRNA有28S, 18S, 5S三条带,我的目的条带应该是在哪条带的位置。这个能看得出来吗,或者通过什么方式能查到?

28s、18s、5s这些都是核糖体RNA,即rRNA,不是mRNA,提取RNA时看到的弥散才是mRNA,一个mRNA就是通常所说的一个功能基因
4楼2010-04-28 13:20:05
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liyong1981

金虫 (正式写手)


要用磁珠吧,你粗提的是总RNA,
5楼2010-04-28 14:55:32
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xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

目的基因在mRNA中的位置

不要用磁珠呀! 我是提取总RNA
6楼2010-04-30 10:23:47
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gastrodia

金虫 (正式写手)

将mRNA序列进行翻译,把不同的翻译结果拿去blast验证阅读框的正确性,一般说来一条mRNA只对应一个蛋白
7楼2010-04-30 10:26:20
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miya173

银虫 (小有名气)

mRNA带是弥散的,把rRNA除去才能看得见。
8楼2010-04-30 22:19:38
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

不太明白

★ ★
lstt09nk(金币+2):积极交流的虫友~~ 2010-05-04 14:59:18
你是说的什么意思?是你跑mRNA时的条带位置还是反转录后的位置。跑mRNA时的位置应该在最下方,它的分子量最大。也就是说靠近负极位置。你说的28s,,8s,5s我怎么不觉得想mRNA啊,倒像是rRNA。还有一个5.8s。你还是想说提取这些做亲缘鉴定啊。要是反转录了,通常就一个条带,我但是提取的植物的总RNA跑电泳有两条带。mRNA在最下方,照此推断动物的总RNA也应该有两条活着两条以上的带。最下方的就是Target。
9楼2010-05-01 07:38:15
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xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

目的基因在mRNA中的位置

谢谢你的建议!
10楼2010-05-04 14:57:15
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