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crystalgirl1

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】单原子的总能量怎么算? 已有13人参与

我想计算FeSiH的结合能,(使用的是castep模块)
根据结合能公式Eb=E(FeSiH)-E(Fe)-E(Si)-E(H),
我听说计算单原子的总能就是把一个单原子放在一个超晶胞里,超晶胞中只有这一个原子。我按照这种方法计算,可以算出Si的能量,但是一算到Fe就失败,请问我这种算法对吗?若对的话为什么Fe就算不了呢?
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)

我的问题依旧没有解决,采用一个老师的建议,选用15*15*15的盒子,然后中心放一个铁原子,计算能量,计算时选上spin polairized,精度降低,可是还是失败。
.castep文档中最后显示的是
  Warning: electronic minimisation did not converge when finding ground state.
  ****************************************************************************
  Writing checkpoint file...

Writing model to 3D_Atomistic.check
Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed.
Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed.
[0] MPI Abort by user Aborting program !
[0] Aborting program!
forrtl: severe (47): write to READONLY file, unit 60, file C:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.1\Gateway\root_default\dsd\jobs\UIPR2\killfile
Image              PC        Routine            Line        Source            
castepexe_mpi.exe  00AB6CC2  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00AB3F50  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00A42B9E  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00A427BB  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00A246D1  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  009F8E7B  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  009F8EAF  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00404AA8  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  004019CB  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00ABE578  Unknown               Unknown  Unknown
castepexe_mpi.exe  00A904BB  Unknown               Unknown  Unknown
kernel32.dll       7C817077  Unknown               Unknown  Unknown


请大家帮帮我!
17楼2010-04-28 15:25:07
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-28 18:48
你的方法是对的,还有一种发放可以解决不收敛的问题。
使用dmol模块,建立一个双原子或三原子的纯团簇,几何优化结构,得到如下结果。


用Total Energy 减去 Binding E,然后除以团簇的原子数,就是单原子的能量了。
这个可以保证收敛,双原子不收敛,三原子也会收敛的。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-04-23 17:58:38
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iamkz

至尊木虫 (小有名气)

寻识小生


gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-23 22:47
结合能是不是就是减去孤立原子的能量?
那样的话你可以把原子放在超晶胞里,然后逐步改变晶格的大小,做一系列的计算,这样得到的曲线最后趋于稳定时的能量应该就是你所要的能量吧
落花焉知流水之意
3楼2010-04-23 18:36:54
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主


hometownlove(金币+1):谢谢交流 2010-04-28 18:48
是不是你的超元胞太大了,稍微小点就行
博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2010-04-23 18:54:14
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