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qli0218

木虫 (小有名气)

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专业: 理论和计算化学

[交流] 【其他】第一性计算数据处理经验有奖征集已有20人参与

现在做第一性原理计算越来越多，但是如何发表高层次的文章却与处理、挖掘所得数据的深度有着密切的联系。所以希望大家互帮互助，分享处理数据的经验。

大家所用软件都不一样，所以得到的数据文件也有不同，所以请大家按照以下格式回帖，写下自己处理数据的例子。

例子：

CODE:

计算软件：DMOL

处理的文件：.grd

应用软件：MATLAB

作用：按照自己的需求画二维电荷密度图

方法：读出.grd中的数据，按照自己的要求重新切面，得到切面上各个坐标的电荷密度，然后画出二维电荷密度图。也可得到电荷密度矩阵倒入origin中绘图。

程序（可选）：如果有自己用得好的程序，也可以共享。

参与回帖者每人奖励5个金币，对于提供程序的回帖者奖励10个金币。

PS:感谢aylayl08版主的帮助

[ Last edited by aylayl08 on 2010-4-6 at 14:22 ]

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1楼2010-04-06 14:11:26

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tjyl

金虫 (正式写手)

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管辖: 程序语言

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):非常感谢，第一个提供程序的，鼓励一下 2010-04-07 13:07
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-07 20:18

前面的代码里freem函数贴出来后显示的有问题。

CODE:

void freem (double **m, int R, int L)

{

  int i;

  for (i = 0; i < R; i++)

    free ( m[i]);

  free (m);

}

如果能带数量多，就加
unset key\n\

CODE:

fprintf(pt, "gnuplot<
        set term post landscape enhanced color dashed defaultplex \"Helvetica\" 14\n\

        set output \'pic.ps\'\n\

        set key outside\n\

        set title \"Energy Band\"\n\

        unset key\n\

        set ylabel \"Energy (Ev)\"\n");

引用回帖:

Originally posted by tjyl at 2010-04-07 10:14:18:
计算软件：abinit
应用软件：C,Gnuplot
作用：直接画一个简单能带图，方便看结果
方法：运行时提取出xxx_EIG里的值，产生一个gnuplot用的脚本，然后把图输出到一个ps文件里。
使用：
以tutorial #3里3.5的输 ...

[ Last edited by tjyl on 2010-4-7 at 10:51 ]

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13楼2010-04-07 10:18:13

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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

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专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

支持一下！

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真理是一点点接近的！

2楼2010-04-06 14:31:47

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christian

木虫 (正式写手)

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专业: 应用化学

支持一下哈！！！那样估计有点难！呵呵！

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你出生的时候，你哭着，周围的人笑着；你逝去的时候，你笑着，而周围的人在哭

5楼2010-04-06 17:01:55

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goldenfisher

金虫 (著名写手)

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qli0218(金币+5):谢谢参与！非常好！ 2010-04-06 18:23

我来说一个，紧跟版主脚步：

计算软件：pwscf
处理的文件：.xsf
应用软件：xcrysden
作用：原子构型图、电荷密度、自旋密度的三维图等
方法：原子构型可以直接在xscrysden中画出。对其它参数，首先利用pwscf计算scf得到体系电荷分布，再经过自带的处理程序得到xsf格式的文件，然后导入xcrysden，选择合适的参数，画出电荷密度的三维分布。现在来说，三维分布更直观，更有意义。

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6楼2010-04-06 17:36:53

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