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crystalgirl1

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by gavinliu7390 at 2010-10-25 11:09:54:


什么意思? 不太明白。

就是对应于Material studio软件中的CASTEP模块中应该怎样操作就是relaxed和unrelaxed,另外有人说relaxed和unrelaxed对应于Material studio中就是指几何优化前后,可是按你说的好像这种观点就是错误的了。
131楼2010-10-26 23:20:12
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我想问一下,在vasp中怎么固定一个原子的两个坐标,只允许它在第三个方向上移动呢?期待…
嘟啦啦嘟啦啦嘟
132楼2010-10-27 09:52:13
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yidiandian2703

铁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
vasp 5.2 编译已经通过了,也得到了vasp
可是一运行就出现segament fault。

查看用到的memory其实很小,而我的机子内存是很大的。

请教各位有没有遇到过类似的问题,怎么解决的? 多谢!
133楼2010-10-27 14:53:12
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bnliu

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我在计算的时候出现这个问题
WARNING: dimensions on CHGCAR file are different
请问,对结果有影响吗?我要如何避免?
人生只有一次
134楼2010-11-05 08:35:12
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):谢谢回复! 2010-11-07 16:48:31
引用回帖:
Originally posted by yidiandian2703 at 2010-10-27 14:53:12:
vasp 5.2 编译已经通过了,也得到了vasp
可是一运行就出现segament fault。

查看用到的memory其实很小,而我的机子内存是很大的。

请教各位有没有遇到过类似的问题,怎么解决的? 多谢!

编译的时候在FFLAG后面添加上-heap-arrays 64试试,以前有过讨论帖,你可以找找
博学、审问、慎思、明辨、笃学
135楼2010-11-05 10:44:24
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boylc789

木虫 (著名写手)

独孤

将要搞这个东东
有种相遇叫缘分;有种责任叫承诺;有份心情叫思念;有种痛苦叫煎熬;有种后悔叫错过;有种等待叫守候。
136楼2010-11-05 21:11:32
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请教前辈两个问题:
finite-temperature这个具体的意思是什么了?或者这有什么意义?
二是VASP中可以做CPMD吗?
前途光明,出路难觅!
137楼2010-11-06 20:33:41
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+3):谢谢回复! 2010-11-07 16:47:48
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-11-06 20:33:41:
请教前辈两个问题:
finite-temperature这个具体的意思是什么了?或者这有什么意义?
二是VASP中可以做CPMD吗?

前辈不敢当,我算半个菜鸟,冒昧回答:
一.finite temperature是提高收敛速度的一种手段,有限温度法,相当于给电子加了一定的激发温度。
VASP计算的是零温基态能量,零温下电子从能量最低的能态开始占据直到费米面处的能态,占据率在费米面以上是零,费米面以下是1。但是这样对于有的体系(特别是金属)很难自洽收敛,因此为了加速收敛,人为地给费米面附近电子占据率附加一定的展宽。这样费米面附近能态的电子占据率就再是1或者0而是由一定的函数决定0到1之间的一个值。这个展宽可以有不同的形式,最常用的就是你提到的finite-temperature,这种方法的展宽采用了一个类似于有限温度下的费米分布函数,因此成为有限温度法,相当于引入了电子温度。这里要注意的是,此时VASP仍然是零温计算,这个温度算是伪温度,只是为了加速收敛,而采用该方法会在总能量里引入一项电子熵,合理的计算结果应该保证电子熵非常小,这就需要在具体计算时从加快收敛速度与减小电子熵之间找到一个平衡(通常二者是矛盾的)
二.不清楚,好像不能,只能做BOMD吧
心之所向无惧无悔
138楼2010-11-07 16:08:09
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zengchangan

铁虫 (初入文坛)

能带图的横坐标的高对称点如何画,急


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
能带图的横坐标点的高对称点如何标明,我的体系是FCC面心立方的,紧急求助
苦心专研奋力拼搏,天道酬勤,好好加油吧!
139楼2010-11-27 10:42:11
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xiaowu787

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
想您请教一下:我计算了Mo的二聚体,结果能量随距离出现波动,你帮着看看哪里有问题,谢谢

1.096965511    1 T=     0. E= -.12705374E+02 F= -.12705374E+02 E0= -.12705374E+02
1.154700538   1 T=     0. E= -.12780717E+02 F= -.12780717E+02 E0= -.12780717E+02  E
1.270170592    1 T=     0. E= -.11772386E+02 F= -.11772386E+02 E0= -.11772386E+02  
1.385640646   1 T=     0. E= -.10208456E+02 F= -.10208456E+02 E0= -.10208456E+02  
1.443375673   1 T=     0. E= -.93910987E+01 F= -.93910987E+01 E0= -.93910987E+01  
1.5011107        1 T=     0. E= -.85955379E+01 F= -.85955379E+01 E0= -.85955379E+01
1.558845727   1 T=     0. E= -.93492208E+01 F= -.93492208E+01 E0= -.93443360E+01  
1.674315781   1 T=     0. E= -.85678977E+01 F= -.85678977E+01 E0= -.85678977E+01
1.847520861     1 T=     0. E= -.95099873E+01 F= -.95099873E+01 E0= -.95099873E+01

INCAR
CODE:
SYSTEM  =  Al-dimer
ENCUT   =  600
ISTART  =  0
ICHARG  =  2

LWAVE   =  F
LREAL   =  F
LCHARG  =  F

SIGMA   =  0.2
ISMEAR  =  -5
ISPIN   =  2

NGX=136;NGY=136;NGZ=136

IBRION  = 0
SMASS   = -2
NSW=10
POTIM=1

#ISIF    =  2
#EDIFF   =  1E-06
GGA     =  PE
VOSKOWN =  1
PREC    =  Accurate

POSCAR
CODE:
Mo-dimer
1.00
14 0 0
0 14 0
0 0 14
2
cart
0.0 0.0 0.0
1.847520861 1.847520861 1.847520861

140楼2010-11-27 17:26:29
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