24小时热门版块排行榜    

查看: 2248  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】急!溶剂化老出错,有关SCRF=read 已有7人参与

在算一个分子的溶剂化优化的时候,因为出现了下面的错误提示:
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen   34 has 2 bounds. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.


于是改用下面输入文件:
# opt freq=noraman b3lyp/3-21g scrf=(solvent=water,read) scf=tight
。。。。。。
sphereonh=34

结果出现错误:
Using the following non-standard input for PCM:
sphereonh=34
End of line while reading PCM input.

于是改成了:
# opt freq=noraman b3lyp/3-21g scrf=(solvent=water,read) scf=tight
。。。。。
Radii=UFF

结果还是相似的错误提示

请问到底应该怎么改啊,快崩溃了,求人指点,难道是我选定的PCM模型有关系,但是以前算类似结构的时候就用sphereonh就能解决的啊,
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★
zhou2009(金币+2): 2010-04-20 09:50
出现End of line while reading PCM input.的原因是你没有在文件末尾添加一个空行导致的,与其他因素无关。
你采用sphereonh=N或者radii=uff都是比较好的解决你提到的问题的方法。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
7楼2010-04-20 09:45:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

libostar

金虫 (正式写手)

不是很了解
2楼2010-03-25 22:40:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢回帖交流 2010-04-20 18:28
Hydrogen   34 has 2 bounds

Check your molecular structure for bad contacts.
3楼2010-03-25 23:47:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

谢谢楼上的回复,是这样的,结构中的第34号H是羟基上的H,和旁边的一个O形成了氢键,所以有上面的错误提示,只是我不知道应该怎么处理这个错误,继续求达人指点!
4楼2010-03-26 09:31:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +20 木水思豆 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 06:35 by echo8914667
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 PbwVEMK5haaE 2026-08-25 5/250 2026-08-26 05:09 by cNXvBfCpiZOM
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 5/250 2026-08-26 04:57 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +18 angus9576 2026-08-25 22/1100 2026-08-26 00:41 by merchancy
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见