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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】急!溶剂化老出错,有关SCRF=read 已有7人参与

在算一个分子的溶剂化优化的时候,因为出现了下面的错误提示:
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen   34 has 2 bounds. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.


于是改用下面输入文件:
# opt freq=noraman b3lyp/3-21g scrf=(solvent=water,read) scf=tight
。。。。。。
sphereonh=34

结果出现错误:
Using the following non-standard input for PCM:
sphereonh=34
End of line while reading PCM input.

于是改成了:
# opt freq=noraman b3lyp/3-21g scrf=(solvent=water,read) scf=tight
。。。。。
Radii=UFF

结果还是相似的错误提示

请问到底应该怎么改啊,快崩溃了,求人指点,难道是我选定的PCM模型有关系,但是以前算类似结构的时候就用sphereonh就能解决的啊,
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mscic

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
因为G09和G03的PCM模型中radii的默认设置是不同的,G03中默认为UA0,G09中默认为UFF。

楼主的第一个错误应该就是RADII选择不合理,那就是为啥你用G09能做而G03就会出错的原因,二者的默认设置是不一样的!

第二个错误的原因是输入的问题,在SCRF后面加了READ之后就要在分子结构后面空一行,再加上Radii=xxxxx。“sphereonh=34”再换行,但是与RADII=XXXX之间不需要空行
11楼2011-10-12 11:12:48
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libostar

金虫 (正式写手)

不是很了解
2楼2010-03-25 22:40:53
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢回帖交流 2010-04-20 18:28
Hydrogen   34 has 2 bounds

Check your molecular structure for bad contacts.
3楼2010-03-25 23:47:23
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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

谢谢楼上的回复,是这样的,结构中的第34号H是羟基上的H,和旁边的一个O形成了氢键,所以有上面的错误提示,只是我不知道应该怎么处理这个错误,继续求达人指点!
4楼2010-03-26 09:31:53
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