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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】关于计算相互作用时的能量校正问题
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-03-19 03:20:10:
个人认为ZPE是必须考虑的。虽然计算AB时A和B的ZPE没有直接给出来，但是你可以单独把它们算出来嘛。所以所以的能量都应该是包含了BSSE和ZPE校正的能量，这样才算合适。


问题就来了：单独计算A或B得ZPE时应该按照什么样的构型来进行？是按照发生相互作用之间各自单独优化后得到的构型来计算各自的ZPE呢，还是从优化好的AB复合物构型里面把A或B的坐标单独导出后作为其构型进行ZPE计算？因为在发生相互作用前后，A和B的构型其实是有变化的。
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11楼2010-03-19 16:09:37
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fooo

金虫 (正式写手)
这里就涉及到两个公式：
dE=dE(prep)+dE(int)
其中dE(prep)是preparation energy,实际上应该就是变形能；dE(int)是形成complex的实际相互作用能。前者从优化好的AB复合物构型里面把A或B的坐标单独导出后作为其构型进行ZPE计算，后者按照发生相互作用之间各自单独优化后得到的构型来计算各自的ZPE。论坛中有相关的帖子，你可以查一查。
引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-19 16:09:37:

问题就来了：单独计算A或B得ZPE时应该按照什么样的构型来进行？是按照发生相互作用之间各自单独优化后得到的构型来计算各自的ZPE呢，还是从优化好的AB复合物构型里面把A或B的坐标单独导出后作为其构型进行ZPE计 ...

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12楼2010-03-20 03:26:45
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2010-03-18 20:52:23:

是啊，版主您是怎么处理这类问题的呢？

Journal of Molecular Graphics and Modelling 27 (2009) 693–700
在zpe的取舍上，这个文章有点意思（这个杂志影响因子只有2.3，不高，因此可信度有折扣）
作者先对他的体系中的某一个过程进行了zpe校正。发现对他研究的体系的规律的影响很小，于是其他的过程都不进行zpe校正了
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13楼2010-03-20 10:42:28
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