24小时热门版块排行榜    

查看: 1841  |  回复: 5

zhgj1979

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】高分子分子动力学模拟的初态设定

一般看到文献上的都是将伸直的高分子链作为初态,然后使其不断松弛,直到体系的密度与实际密度相符为止。

对这里面的某些细节不是很清楚:
1. 最初的格子将会很大,由于分子链是伸直状态。那是否一定要采用立方周期性的格子?
2.分子链在松弛过程中,在程序中如何实现将开始的大的格子不断“收缩”为实际的高分子占用的体积格子?

小弟刚刚开始学习分子动力学,问题肤浅,请多指教!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
zhgj1979(金币+5):谢谢指教 2010-02-04 07:55
lei0736(金币+2):谢谢 欢迎常来 2010-02-04 10:41
不一定,体系的初始状态可以是随即的,体系运行一段是时间后体系会忘记以前的状态,从此刻开始计算你所需要的性质,

松弛过程中高分子是否收缩取决于相互作用参数。

cheers
2楼2010-02-03 23:04:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chawk

木虫 (小有名气)

学习啦
大家说的太好啦!大家齐努力,改造地球啊!俺是农民,俺有把小锄头哦`(~_~)`
3楼2011-01-16 20:41:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangtao9571

新虫 (正式写手)


御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-14 21:25:11
变格子在模拟中是能做到的额!!
4楼2011-04-13 16:33:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

9988michel

银虫 (小有名气)


御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-14 21:25:01
我觉得是要用周期性边界条件的,而且你这个变化前的不稳定阶段可以通过设置动力学代码不记录,值输出你所学的东西。晶格大小是根据你设置的参数来的
脚比路长。
5楼2011-04-14 17:09:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

roy_allen

银虫 (小有名气)

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-15 14:57:10
可以在MS中通过AC模块构建所要的格子,然后在NPT系综下进行弛豫,可以优化格子的尺寸,使其达到密度的稳定(可以弛豫过程中的密度变化图),但具体所得密度是否是和现实接近,这个取决于力场的准确性。接下来,便可以进行后续的研究。
6楼2011-04-15 14:51:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhgj1979 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 6/300 2026-08-15 09:28 by sunzitan
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 7/350 2026-08-15 09:09 by 4wMiSEwB6436
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +24 医学老男孩 2026-08-13 50/2500 2026-08-15 06:38 by 学员8dgXkO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 7/350 2026-08-15 00:40 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见