24小时热门版块排行榜    

查看: 4006  |  回复: 18
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】哪个模拟软件国外比较认可 已有5人参与

如题
如果想发文章的话,哪个分子模拟软件是比较容易让那帮老外接受的呢?
有个师兄曾经说过好像Gromacs在美国就不太吃的开,因为gromacs是英国人开发的,美国人很瞧不起,那其他软件呢?论坛里有CPMD,似乎这个软件虽然是免费的,但很少人买账哟。
本人在SD数据库中检索一下,似乎文章数是Amber>Desmond>Gromacs>NAMD>LAMMPS(这么做可能很无聊)。
尽管不同的软件功能上有所区别,但这是不是也反应了些什么。用软件的话还是要有倾向性的好,毕竟发文章的话都是给外国人看的,投其所好嘛。
希望高手们指点一下,哪个软件最受老外欢迎。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的鱼

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2010-01-24 20:07:56:
看什么领域吧
例如你说的LAMMPS在金属 合金这块应该是最大最强的

请问一下高手,amber是不是不可以做蛋白嵌入磷脂层的体系?
科研就是讨论出来的
8楼2010-09-10 08:51:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看什么领域吧
例如你说的LAMMPS在金属 合金这块应该是最大最强的
2楼2010-01-24 20:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+5):谢谢 1-24 20:30
Gromacs的发源地是荷兰的格罗宁根,现在三个主要作者中两个在瑞典一个在马普所(这个人似乎也去了瑞典?未考证),没听说是英国人开发的啊。Gromacs发的文章JACS和PRL都有,应该没有被美国人瞧不起吧。

CPMD买帐的人应该很多吧。至少有很多篇JACS。而CPMD本身的算法就发在PRL上。

NAMD很流行,Amber很好用,DL_POLY很全面,Lammps不熟悉但应该也很强大,这几个软件做MD应该都没有问题。

我觉得LZ应该从自己的需要来选择软件吧,如果做经典MD,可以试试NAMD/VMD,软件本身很强大,而且国内国外用的人都很多,遇到问题也容易寻求帮助。
3楼2010-01-24 20:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-1-24 20:11:
Gromacs的发源地是荷兰的格罗宁根,现在三个主要作者中两个在瑞典一个在马普所(这个人似乎也去了瑞典?未考证),没听说是英国人开发的啊。Gromacs发的文章JACS和PRL都有,应该没有被美国人瞧不起吧。

CPMD买 ...

受益匪浅
4楼2010-01-24 20:29:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+4 David1982 2026-10-13 7/350 2026-10-14 14:24 by 13108017953
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +10 Isak0320 2026-10-12 14/700 2026-10-14 11:39 by thegarfield
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见