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minmin_0082003金虫 (正式写手)
莫愁莫愁
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[交流]
【求助】siesta如何让固定衬底？ 已有7人参与
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在计算多层的surface的时候，常常会固定除表层外的其他层面，请问在固定的过程中是，直接固定每层的每个原子就可以吗？ 比如说，我一共要算4层的，但是要固定底下面的3层。我把每个原子都固定住了，如下： %block GeometryConstraints Position 1 position from 3 to 5 position from 5 to 9 position from 11 to 13 position from 15 to 17 position from 19 to 21 position from 23 to 25 position from 27 to 29 position from 31 to 33 position from 35 to 36 %endblock GeometryConstraints 这样的固定方法正确。 |
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 siesta问题 |
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wangsong1016
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7楼2010-05-09 22:44:59
zhangguangping
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siesta如何让固定衬底？
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minmin_0082003(金币+1):谢谢参与
ice_rain(金币+2):xiexie!~ 2010-03-24 21:42
minmin_0082003(金币+1):谢谢参与
ice_rain(金币+2):xiexie!~ 2010-03-24 21:42
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你的这种方法可行@ 还有一种方法，就是使用zmtrix,如下： %block Zmatrix cartesian 4 0.832500 1.441900 0.070000 0 0 0 4 0.832500 4.325700 0.070000 0 0 0 4 0.832500 7.209500 0.070000 0 0 0 4 3.329900 0.000000 0.070000 0 0 0 4 3.329900 2.883800 0.070000 0 0 0 4 3.329900 5.767600 0.070000 0 0 0 4 5.827400 -1.441900 0.070000 0 0 0 4 5.827400 1.441900 0.070000 0 0 0 4 5.827400 4.325700 0.070000 0 0 0 1 3.602290 1.731278 6.212320 1 1 1 1 3.319832 2.314888 7.483680 1 1 1 1 2.095981 1.995008 8.160953 1 1 1 1 1.179880 1.055287 7.579063 1 1 1 1 1.463109 0.470284 6.307043 1 1 1 1 2.686364 0.792157 5.629784 1 1 1 2 4.560824 2.006388 5.644557 1 1 1 2 4.060912 3.044923 7.962504 1 1 1 2 0.218799 0.778868 8.141618 1 1 1 2 0.720051 -0.260182 5.831012 1 1 1 2 2.264637 3.524194 9.544223 1 1 1 2 0.774280 2.665518 9.602215 1 1 1 2 4.021096 0.084236 4.221899 1 1 1 2 2.491712 -0.710195 4.216641 1 1 1 3 1.840356 2.531978 9.498710 0 0 1 3 2.958183 0.262423 4.292613 0 0 1 4 2.438337 1.576108 2.385995 0 0 1 4 2.578104 1.329674 11.405459 0 0 1 4 1.665000 0.000000 13.722500 0 0 0 4 1.665000 2.883800 13.722500 0 0 0 4 1.665000 5.767600 13.722500 0 0 0 4 4.162400 -1.441900 13.722500 0 0 0 4 4.162400 1.441900 13.722500 0 0 0 4 4.162400 4.325700 13.722500 0 0 0 4 6.659800 -2.883800 13.722500 0 0 0 4 6.659800 0.000000 13.722500 0 0 0 4 6.659800 2.883800 13.722500 0 0 0 %endblock Zmatrix 第一列是元素序号，后面三列是相应的原子的cartesian坐标，后面的0表示固定相应的自由度，1表示放开相应的自由度！这个你可以从手册找到！我用过这种固定方法，并且，还可以加限制！ |
2楼2010-03-24 11:33:14
zhangguangping
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