应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta如何让固定衬底？
51/1返回列表
查看: 2922  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁

[交流] 【求助】siesta如何让固定衬底？ 已有7人参与

在计算多层的surface的时候，常常会固定除表层外的其他层面，请问在固定的过程中是，直接固定每层的每个原子就可以吗？
比如说，我一共要算4层的，但是要固定底下面的3层。我把每个原子都固定住了，如下：
%block GeometryConstraints
Position 1
position from 3 to 5
position from 5 to 9
position from 11 to 13
position from 15 to 17
position from 19 to 21
position from 23 to 25
position from 27 to 29
position from 31 to 33
position from 35 to 36
%endblock GeometryConstraints

这样的固定方法正确。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

siesta问题

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-01-19 09:36:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

北极苍狼

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我是用MS建的模型，请问第二种方法中的笛卡尔坐标系就是MS导出的直角坐标系吗，为什么我用siesta计算时结果会先给出笛卡尔坐标系，再给出直角坐标系，并且还不一样
赞一下 回复此楼
10楼2012-04-23 22:30:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

zhangguangping

木虫 (著名写手)

siesta如何让固定衬底？

★ ★ ★
minmin_0082003(金币+1):谢谢参与
ice_rain(金币+2):xiexie!~ 2010-03-24 21:42
你的这种方法可行@
还有一种方法，就是使用zmtrix,如下：
%block Zmatrix                                                               
cartesian                                                                     
4     0.832500     1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     0.832500     4.325700     0.070000    0    0    0                       
4     0.832500     7.209500     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     0.000000     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     2.883800     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     5.767600     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400    -1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400     1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400     4.325700     0.070000    0    0    0                       
1     3.602290     1.731278     6.212320    1    1    1                     
1     3.319832     2.314888     7.483680    1    1    1                       
1     2.095981     1.995008     8.160953    1    1    1                       
1     1.179880     1.055287     7.579063    1    1    1                       
1     1.463109     0.470284     6.307043    1    1    1                       
1     2.686364     0.792157     5.629784    1    1    1                       
2     4.560824     2.006388     5.644557    1    1    1                       
2     4.060912     3.044923     7.962504    1    1    1                       
2     0.218799     0.778868     8.141618    1    1    1                       
2     0.720051    -0.260182     5.831012    1    1    1                       
2     2.264637     3.524194     9.544223    1    1    1                       
2     0.774280     2.665518     9.602215    1    1    1                       
2     4.021096     0.084236     4.221899    1    1    1                       
2     2.491712    -0.710195     4.216641    1    1    1                       
3     1.840356     2.531978     9.498710    0    0    1                       
3     2.958183     0.262423     4.292613    0    0    1                     
4     2.438337     1.576108     2.385995    0    0    1                       
4     2.578104     1.329674    11.405459    0    0    1                       
4     1.665000     0.000000    13.722500    0    0    0                     
4     1.665000     2.883800    13.722500    0    0    0                       
4     1.665000     5.767600    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400    -1.441900    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400     1.441900    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400     4.325700    13.722500    0    0    0                       
4     6.659800    -2.883800    13.722500    0    0    0                     
4     6.659800     0.000000    13.722500    0    0    0                       
4     6.659800     2.883800    13.722500    0    0    0                       
%endblock Zmatrix            
第一列是元素序号，后面三列是相应的原子的cartesian坐标，后面的0表示固定相应的自由度，1表示放开相应的自由度！这个你可以从手册找到！我用过这种固定方法，并且，还可以加限制！
赞一下(3人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2010-03-24 11:33:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
qasd(金币+2):xiexie 2010-04-10 20:00
你可以参考一下seista-3.0-b的manual的第33-34页！
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2010-03-24 13:55:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lionz

银虫 (初入文坛)
minmin_0082003(金币+1):谢谢参与
aylayl08(金币-1):禁止无意义回帖，扣回所得 2010-05-09 18:33:25
Thanks Zhangguangping
赞一下(3人) 回复此楼
4楼2010-04-09 10:38:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 14:41 by QXtWNz7PI7wZ
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:41 by KxMI1BYBxWX1
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 7lpolszZVXgi 2026-08-14 8/400 2026-08-15 11:53 by KxMI1BYBxWX1
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 6/300 2026-08-15 09:28 by sunzitan
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:41 by 4wMiSEwB6436
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭