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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS三维模型中显示原子编号
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huangliwu84

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】MS三维模型中显示原子编号

在计算出的Atomic population和 bond population结果中,每个原子都有一个编号,如对于Na原子,有Na1,Na2... 想请教一下各位怎样在三维模型中显示出相应的原子编号.谢谢了.
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1楼 2010-01-18 18:52:32
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huangliwu84

木虫 (著名写手)
首先谢谢7楼的回复.但是还是不能在三维模型中找到与population中对应的各个原子的原子编号.如下表所示(计算后的各原子的坐标),  对于"H", 其"Atom Number"从1-32, 但是在三维模型中却显示不出像这样的编号,各位是否有相关办法能在三维模型中显示出来对应的带有编号的原子?谢谢了.
                  -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  H            1         0.207961   0.305682   0.303434   x
            x  H            2         0.138726   0.316222   0.875927   x
            x  H            3         0.010099   0.290269   0.052611   x
            x  H            4         0.123775   0.986911   0.075088   x
            x  H            5         0.707961   0.805682   0.303434   x
            x  H            6         0.638726   0.816222   0.875927   x
            x  H            7         0.510099   0.790269   0.052611   x
            x  H            8         0.623775   1.486911   0.075088   x
            x  H            9        -0.207961   0.305682   0.196566   x
            x  H           10        -0.138726   0.316222  -0.375927   x
            x  H           11        -0.010099   0.290269   0.447389   x
            x  H           12        -0.123775   0.986911   0.424912   x
            x  H           13         0.292039   0.805682   0.196566   x
            x  H           14         0.361274   0.816222  -0.375927   x
            x  H           15         0.489901   0.790269   0.447389   x
            x  H           16         0.376225   1.486911   0.424912   x
            x  H           17        -0.207961  -0.305682  -0.303434   x
            x  H           18        -0.138726  -0.316222  -0.875927   x
            x  H           19        -0.010099  -0.290269  -0.052611   x
            x  H           20        -0.123775  -0.986911  -0.075088   x
            x  H           21         0.292039   0.194318  -0.303434   x
            x  H           22         0.361274   0.183778  -0.875927   x
            x  H           23         0.489901   0.209731  -0.052611   x
            x  H           24         0.376225  -0.486911  -0.075088   x
            x  H           25         0.207961  -0.305682   0.803434   x
            x  H           26         0.138726  -0.316222   1.375927   x
            x  H           27         0.010099  -0.290269   0.552611   x
            x  H           28         0.123775  -0.986911   0.575088   x
            x  H           29         0.707961   0.194318   0.803434   x
            x  H           30         0.638726   0.183778   1.375927   x
            x  H           31         0.510099   0.209731   0.552611   x
            x  H           32         0.623775  -0.486911   0.575088   x
            x  Mg           1         0.264391   0.485957   0.083411   x
            x  Mg           2         0.764391   0.985957   0.083411   x
            x  Mg           3        -0.264391   0.485957   0.416589   x
            x  Mg           4         0.235609   0.985957   0.416589   x
            x  Mg           5        -0.264391  -0.485957  -0.083411   x
            x  Mg           6         0.235609   0.014043  -0.083411   x
            x  Mg           7         0.264391  -0.485957   0.583411   x
            x  Mg           8         0.764391   0.014043   0.583411   x
            x  Mg           9         0.000000   0.022971   0.250000   x
            x  Mg          10         0.000000   0.525662   0.250000   x
            x  Mg          11         0.500000   0.522971   0.250000   x
            x  Mg          12         0.500000   1.025662   0.250000   x
            x  Mg          13         0.000000  -0.022971  -0.250000   x
            x  Mg          14         0.000000  -0.525662  -0.250000   x
            x  Mg          15         0.500000   0.477029  -0.250000   x
            x  Mg          16         0.500000  -0.025662  -0.250000   x
            x  Ni           1         0.119922   0.229326   0.080419   x
            x  Ni           2         0.619922   0.729326   0.080419   x
            x  Ni           3        -0.119922   0.229326   0.419581   x
            x  Ni           4         0.380078   0.729326   0.419581   x
            x  Ni           5        -0.119922  -0.229326  -0.080419   x
            x  Ni           6         0.380078   0.270674  -0.080419   x
            x  Ni           7         0.119922  -0.229326   0.580419   x
            x  Ni           8         0.619922   0.270674   0.580419   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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9楼2010-01-19 17:50:35
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 1-20 12:58
需要在左下name那自己写
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2010-01-18 19:02:30
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huangliwu84

木虫 (著名写手)
先谢谢2楼的回答.根据这个方法虽然可以添加原子的编号,但是还是不能在三维模型中找到与bond population中对应的原子编号啊,因为这样看上去是随意的,而bond population中的原子的编号是对应于三维模型中的相应原子.例如Na1-O2,Na1-O1,如果手动填加的话,怎么才能在三维模型中找出对应的原子呢?也就是说怎么知道哪个原子是O1以及哪个原子是O2?(O1和O2都是O原子,只是原子位置不同,而三维模型中只能看出是O,但是没有诸如有编号的O1和O2.)谢谢了!

[ Last edited by huangliwu84 on 2010-1-18 at 21:57 ]
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4楼2010-01-18 21:45:01
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 1-20 13:00
右键--->Label，在properties里选Name，然后点Apply。
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5楼2010-01-18 22:30:56
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