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wordsworth3180

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】质粒pcr假阳性问题

请问大家,筛选重组克隆时,用碱裂解法提取转化子的质粒,然后用提取的质粒做模板进行pcr验证。虽然提取的质粒有时弥散,但pcr为阳性,这种情况下,请问虫虫们,假阳性的概率多大?
因为测序需要自己设计引物,所以想有把握了再测序,希望大家给分析一下!
多谢了!
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linxi8579

铜虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 彬心玉壶 at 2010-1-10 14:58:



好在不用提DNA或者质粒,节约时间,先可以大致筛选一遍。

要是你先挑菌落做菌落PCR验证了,在去平板挑原菌落做PCR或者摇菌的,第一你要先标记号位置,其次一般经过9~12个小时的培养,菌落没有那么大吧, ...

我们的方法是可以挑第二次的,就是在平板上画格子,然后一个格子里用枪头画三条,长出来不是单菌落啊,可以挑好多次的。不过用菌液PCR也许更均匀更利于定量吧。
15楼2010-01-14 16:37:32
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匿名

用户注销 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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2楼2009-12-31 07:21:05
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匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
3楼2009-12-31 07:25:21
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yangym1123

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一般我们都是用菌液PCR用自己的特异引物来验证的,有一定的假阳性率,我做了三年也就出来一两个假阳性吧,整理提取后酶切验证时最好的办法,如果切下来你的目的条带,说明载体上肯定有你的插入片段啊,另外提取的质粒弥散可能是因为有蛋白(DNA酶的污染),再重提就是啦!
4楼2009-12-31 08:49:36
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