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Jack_dong

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】图位克隆 已有9人参与

想要通过图位克隆,明确突变基因,不知道如何操作?
请朋友们献言帮助。

拟南芥 质量性状表型突变体   现在的结果显示,该突变体为3:1隐性突变

突变体为col-0背景

现在已获得和 ller 生态型之间的杂交材料F2代

想确定 突变位点  应该如何进行  ?

[ Last edited by Jack_dong on 2010-5-9 at 09:24 ]
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sobeit

铁虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
三个小石子(金币+2):感谢参与讨论,欢迎常来理工农林版! 2010-09-08 23:31:42
首先你要筛选在双亲间具有多态性的标记,质量性状你可以当作一个多态性标记加入,然后再构建标记连锁图的过程中,这个质量性状一般会被定位在某两个标记之间,然后你需要在含有目标基因的染色体区段加密标记做精细定位,注意你要做精细定位需要的群体比较大,这样才能捕捉到标记和基因的重组,在做精细定位的过程中你会找到一些重组单株,就是标记和基因有重组的单株,挑出这些单株来进一步加密标记,在田间考察表型(注意种植亲本做对照),直到没有重组单株为止,这样你就获得了和基因紧密连锁的标记,然后构建文库,以这个标记筛选阳性克隆测序,利用软件预测ORF,然后功能验证。笼统来说基本就是这样吧。拟南芥基因组小而且已经有完整的序列,做起来是比较方便的。
11楼2010-05-09 16:59:41
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Jack_dong

银虫 (小有名气)

留个言吧,朋友

给点建议   

或者 你有同样问题 也可以跟帖
2楼2009-12-23 18:23:13
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Science298

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
seamuse(金币+1,VIP+0):感谢讨论交流,欢迎常来理工农林版! 12-29 19:00
seamuse(金币+2,VIP+0):欢迎积极参与理工农林版的交流,给Jack_dong进一步的指导帮助! 1-2 17:57
不知道你做的什么材料,也不知道你构建了什么群体。就我做的课题范围给你推荐几篇文章了,希望对你有用,不过文章要自己下了!呵呵
Yi B, Chen Y, Lei S, Tu J, Fu T. Fine mapping of the recessive genic male-sterile gene (Bnms1) in Brassica napus L. Theor Appl Genet. 2006, 113: 643-650
167.        Xiao L, Yi B, Chen Y F, Huang Z, Chen W, Ma C Z, Tu J X, Fu T D. Molecular markers linked to Bn;rf: a recessive epistatic inhibitor gene of recessive genic male sterility in Brassica napus L., Euphytica, 2008, 164: 377-384
3楼2009-12-29 17:17:24
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Jack_dong

银虫 (小有名气)

谢谢建议!
我做的是拟南芥---应该来说是最简单的,但是我们这边没有人会!
我现在已经得到col-0  和 ler 的杂交F2代 种子

想知道 如何克隆  尤其是 精细克隆

请指导

谢谢!
4楼2010-01-02 17:37:20
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