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CyRhmU.jpeg
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holysong

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lfengxia82 at 2009-12-9 11:10:
你好,你把Gaussian的输出文件的出错部分考出来,我试着看看吧

Entering Link 1 = d:\program files\gaussian03\l1.exe PID=      1544.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003, Gaussian, Inc.
                  All Rights Reserved.
  
(略)

*********************************************
Gaussian 03:  x86-Win32-G03RevB.03 4-May-2003
                  09-Dec-2009
*********************************************
%chk=fanyingwu
%mem=6MW
%nproc=1
Will use up to    1 processors via shared memory.
Default route:  MaxDisk=2000MB
------------------------------------
#t rhf/6-31g(d) opt=(qst2) freq test
------------------------------------
--------
guodutai
--------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                    1    B1
C                    2    B2       1    A1
C                    1    B3       2    A2       3    D1       0
C                    3    B4       2    A3       1    D2       0
O                    5    B5       3    A4       2    D3       0
H                    1    B6       4    A5       5    D4       0
H                    1    B7       4    A6       5    D5       0
H                    2    B8       1    A7       4    D6       0
H                    2    B9       1    A8       4    D7       0
H                    3    B10      2    A9       1    D8       0
H                    4    B11      1    A10      2    D9       0
H                    4    B12      1    A11      2    D10      0
H                    6    B13      5    A12      3    D11      0
       Variables:
  B1                    1.53877                  
  B2                    1.49329                  
  B3                    1.53626                  
  B4                    1.34837                  
  B5                    1.35782                  
  B6                    1.10432                  
  B7                    1.10461                  
  B8                    1.10623                  
  B9                    1.10539                  
  B10                   1.08801                  
  B11                   1.10489                  
  B12                   1.1053                  
  B13                   0.9499                  
  A1                  105.44962                  
  A2                  106.76817                  
  A3                  110.71804                  
  A4                  129.13598                  
  A5                  110.91716                  
  A6                  111.19877                  
  A7                  111.85289                  
  A8                  112.08702                  
  A9                  121.80708                  
  A10                 112.39406                  
  A11                 112.28483                  
  A12                 107.22181                  
  D1                    3.17736                  
  D2                   -2.08363                  
  D3                 -179.84156                  
  D4                  117.94919                  
  D5                 -124.70105                  
  D6                 -117.02707                  
  D7                  123.97197                  
  D8                  177.93983                  
  D9                 -123.49883                  
  D10                 116.95305                  
  D11                  -0.23416                  

------
chanwu
------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                    1    B1
C                    2    B2       1    A1
C                    1    B3       2    A2       3    D1       0
C                    3    B4       2    A3       1    D2       0
O                    5    B5       3    A4       2    D3       0
H                    1    B6       4    A5       5    D4       0
H                    1    B7       4    A6       5    D5       0
H                    2    B8       1    A7       4    D6       0
H                    2    B9       1    A8       4    D7       0
H                    3    B10      2    A9       1    D8       0
H                    3    B11      2    A10      1    D9       0
H                    4    B12      1    A11      2    D10      0
H                    4    B13      1    A12      2    D11      0
       Variables:
  B1                    1.5285                  
  B2                    1.52421                  
  B3                    1.52441                  
  B4                    1.51407                  
  B5                    1.21314                  
  B6                    1.10642                  
  B7                    1.10515                  
  B8                    1.10728                  
  B9                    1.10477                  
  B10                   1.10596                  
  B11                   1.10642                  
  B12                   1.1049                  
  B13                   1.10736                  
  A1                  106.67129                  
  A2                  106.69076                  
  A3                  105.84869                  
  A4                  125.14316                  
  A5                  110.59885                  
  A6                  111.75877                  
  A7                  110.54062                  
  A8                  111.64708                  
  A9                  112.21546                  
  A10                 111.68617                  
  A11                 112.26462                  
  A12                 111.6901                  
  D1                   23.7241                  
  D2                  -18.93884                  
  D3                 -172.72129                  
  D4                  101.36668                  
  D5                 -141.24702                  
  D6                  -96.5748                  
  D7                  146.17268                  
  D8                 -141.00763                  
  D9                  100.40737                  
  D10                -140.98568                  
  D11                 100.33056                  

Iteration  1 RMS(Cart)=  0.09321403 RMS(Int)=  0.51653388
Iteration  2 RMS(Cart)=  0.07734370 RMS(Int)=  0.43124425
Iteration  3 RMS(Cart)=  0.07953077 RMS(Int)=  0.35751224
Iteration  4 RMS(Cart)=  0.08054519 RMS(Int)=  0.29467250
Iteration  5 RMS(Cart)=  0.06941081 RMS(Int)=  0.24840540
Iteration  6 RMS(Cart)=  0.06405516 RMS(Int)=  0.21316024
Iteration  7 RMS(Cart)=  0.04197989 RMS(Int)=  0.18791852
Iteration  8 RMS(Cart)=  0.02958841 RMS(Int)=  0.16915231
Iteration  9 RMS(Cart)=  0.02543907 RMS(Int)=  0.15565835
Iteration 10 RMS(Cart)=  0.02086834 RMS(Int)=  0.14744635
Iteration 11 RMS(Cart)=  0.01849471 RMS(Int)=  0.14289618
Iteration 12 RMS(Cart)=  0.01665190 RMS(Int)=  0.14087187
Iteration 13 RMS(Cart)=  0.01416291 RMS(Int)=  0.14042702
Iteration 14 RMS(Cart)=  0.00917526 RMS(Int)=  0.13965135
Iteration 15 RMS(Cart)=  0.00803968 RMS(Int)=  0.13910680
Iteration 16 RMS(Cart)=  0.00743055 RMS(Int)=  0.13893806
Iteration 17 RMS(Cart)=  0.00695107 RMS(Int)=  0.13912132
Iteration 18 RMS(Cart)=  0.00463958 RMS(Int)=  0.13935314
Iteration 19 RMS(Cart)=  0.00241846 RMS(Int)=  0.13924414
Iteration 20 RMS(Cart)=  0.00187412 RMS(Int)=  0.13909274
Iteration 21 RMS(Cart)=  0.00165410 RMS(Int)=  0.13895114
Iteration 22 RMS(Cart)=  0.00148990 RMS(Int)=  0.13882913
Iteration 23 RMS(Cart)=  0.00135247 RMS(Int)=  0.13872554
Iteration 24 RMS(Cart)=  0.00123130 RMS(Int)=  0.13863768
Iteration 25 RMS(Cart)=  0.00112257 RMS(Int)=  0.13856302
Iteration 26 RMS(Cart)=  0.00102420 RMS(Int)=  0.13849944
Iteration 27 RMS(Cart)=  0.00093482 RMS(Int)=  0.13844517
Iteration 28 RMS(Cart)=  0.00085341 RMS(Int)=  0.13839877
Iteration 29 RMS(Cart)=  0.00077916 RMS(Int)=  0.13835902
Iteration 30 RMS(Cart)=  0.00071137 RMS(Int)=  0.13832490
Iteration 31 RMS(Cart)=  0.00064946 RMS(Int)=  0.13829556
Iteration 32 RMS(Cart)=  0.00059291 RMS(Int)=  0.13827030
Iteration 33 RMS(Cart)=  0.00054123 RMS(Int)=  0.13824849
Iteration 34 RMS(Cart)=  0.00049402 RMS(Int)=  0.13822964
Iteration 35 RMS(Cart)=  0.00045090 RMS(Int)=  0.13821331
Iteration 36 RMS(Cart)=  0.00041150 RMS(Int)=  0.13819913
Iteration 37 RMS(Cart)=  0.00037551 RMS(Int)=  0.13818681
Iteration 38 RMS(Cart)=  0.00034265 RMS(Int)=  0.13817606
Iteration 39 RMS(Cart)=  0.00031264 RMS(Int)=  0.13816668
Iteration 40 RMS(Cart)=  0.00028525 RMS(Int)=  0.13815847
Iteration 41 RMS(Cart)=  0.00026023 RMS(Int)=  0.13815127
Iteration 42 RMS(Cart)=  0.00023740 RMS(Int)=  0.13814494
Iteration 43 RMS(Cart)=  0.00021656 RMS(Int)=  0.13813938
Iteration 44 RMS(Cart)=  0.00019754 RMS(Int)=  0.13813447
Iteration 45 RMS(Cart)=  0.00018018 RMS(Int)=  0.13813013
Iteration 46 RMS(Cart)=  0.00016435 RMS(Int)=  0.13812629
Iteration 47 RMS(Cart)=  0.00014989 RMS(Int)=  0.13812288
Iteration 48 RMS(Cart)=  0.00013671 RMS(Int)=  0.13811985
Iteration 49 RMS(Cart)=  0.00012468 RMS(Int)=  0.13811716
Iteration 50 RMS(Cart)=  0.00011371 RMS(Int)=  0.13811476
Iteration 51 RMS(Cart)=  0.00010370 RMS(Int)=  0.13811261
Iteration 52 RMS(Cart)=  0.00009457 RMS(Int)=  0.13811070
Iteration 53 RMS(Cart)=  0.00008624 RMS(Int)=  0.13810898
Iteration 54 RMS(Cart)=  0.00007864 RMS(Int)=  0.13810745
Iteration 55 RMS(Cart)=  0.00007171 RMS(Int)=  0.13810607
Iteration 56 RMS(Cart)=  0.00006539 RMS(Int)=  0.13810483
Iteration 57 RMS(Cart)=  0.00005963 RMS(Int)=  0.13810371
Iteration 58 RMS(Cart)=  0.00005437 RMS(Int)=  0.13810271
Iteration 59 RMS(Cart)=  0.00004958 RMS(Int)=  0.13810180
Iteration 60 RMS(Cart)=  0.00004521 RMS(Int)=  0.13810099
Iteration 61 RMS(Cart)=  0.00004122 RMS(Int)=  0.13810025
Iteration 62 RMS(Cart)=  0.00003759 RMS(Int)=  0.13809958
Iteration 63 RMS(Cart)=  0.00003427 RMS(Int)=  0.13809898
Iteration 64 RMS(Cart)=  0.00003125 RMS(Int)=  0.13809844
Iteration 65 RMS(Cart)=  0.00002849 RMS(Int)=  0.13809794
Iteration 66 RMS(Cart)=  0.00002598 RMS(Int)=  0.13809750
Iteration 67 RMS(Cart)=  0.00002369 RMS(Int)=  0.13809709
Iteration 68 RMS(Cart)=  0.00002160 RMS(Int)=  0.13809672
Iteration 69 RMS(Cart)=  0.00001969 RMS(Int)=  0.13809639
Iteration 70 RMS(Cart)=  0.00001796 RMS(Int)=  0.13809609
Iteration 71 RMS(Cart)=  0.00001637 RMS(Int)=  0.13809581
Iteration 72 RMS(Cart)=  0.00001493 RMS(Int)=  0.13809556
Iteration 73 RMS(Cart)=  0.00001361 RMS(Int)=  0.13809534
Iteration 74 RMS(Cart)=  0.00001241 RMS(Int)=  0.13809513
Iteration 75 RMS(Cart)=  0.00001131 RMS(Int)=  0.13809494
Iteration 76 RMS(Cart)=  0.00001032 RMS(Int)=  0.13809477
Iteration 77 RMS(Cart)=  0.00000940 RMS(Int)=  0.13809462
Iteration 78 RMS(Cart)=  0.00000857 RMS(Int)=  0.13809448
Iteration 79 RMS(Cart)=  0.00000782 RMS(Int)=  0.13809435
Iteration 80 RMS(Cart)=  0.00000713 RMS(Int)=  0.13809423
Iteration 81 RMS(Cart)=  0.00000650 RMS(Int)=  0.13809413
Iteration 82 RMS(Cart)=  0.00000593 RMS(Int)=  0.13809403
Iteration 83 RMS(Cart)=  0.00000540 RMS(Int)=  0.13809394
Iteration 84 RMS(Cart)=  0.00000493 RMS(Int)=  0.13809386
Iteration 85 RMS(Cart)=  0.00000449 RMS(Int)=  0.13809379
Iteration 86 RMS(Cart)=  0.00000409 RMS(Int)=  0.13809372
Iteration 87 RMS(Cart)=  0.00000373 RMS(Int)=  0.13809366
Iteration 88 RMS(Cart)=  0.00000340 RMS(Int)=  0.13809361
Iteration 89 RMS(Cart)=  0.00000310 RMS(Int)=  0.13809356
Iteration 90 RMS(Cart)=  0.00000283 RMS(Int)=  0.13809351
Iteration 91 RMS(Cart)=  0.00000258 RMS(Int)=  0.13809347
Iteration 92 RMS(Cart)=  0.00000235 RMS(Int)=  0.13809343
Iteration 93 RMS(Cart)=  0.00000214 RMS(Int)=  0.13809340
Iteration 94 RMS(Cart)=  0.00000196 RMS(Int)=  0.13809337
Iteration 95 RMS(Cart)=  0.00000178 RMS(Int)=  0.13809334
Iteration 96 RMS(Cart)=  0.00000163 RMS(Int)=  0.13809331
Iteration 97 RMS(Cart)=  0.00000148 RMS(Int)=  0.13809329
Iteration 98 RMS(Cart)=  0.00000135 RMS(Int)=  0.13809327
Iteration 99 RMS(Cart)=  0.00000123 RMS(Int)=  0.13809325
Iteration100 RMS(Cart)=  0.00000112 RMS(Int)=  0.13809323
New curvilinear step not converged.
***** Convergence failure in GTrans *****
Try using 3 structures as input for
QST transition state search
Error termination via Lnk1e in d:\program files\gaussian03\l101.exe at Wed Dec 09 12:19:30 2009.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      7 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

这是输出文件的内容。。。
学习贯穿在生活之中!学无止境!
11楼2009-12-09 12:20:42
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)


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引用回帖:
Originally posted by holysong at 2009-12-9 12:20:

Entering Link 1 = d:\program files\gaussian03\l1.exe PID=      1544.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003, Gaussian, Inc.
                  All Rights Reserved.
  
(略)
  ...

这个错误是由于你的输入文件两个结构的原子编号不对应引起的,你仔细检查下原子编号,就能发现错误所在。更改编号即可。
12楼2009-12-09 22:10:36
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★ ★ ★ ★
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yjcmwgk(金币+3,VIP+0): 12-10 10:15
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 12-10 10:17
qstn方法中,所有原子必须一一对应,把你的文件拆开看看就知道你的编号错位了。
你本意是6号氧上的14号H迁移到3号C上,可是你的产物中,14号H跑到4号C上了,
顶掉了13号H,而13号H顶掉了12号H,被顶掉的12号H迁移到3号C上,这种过渡态
gaussian要是能找到就见鬼了。

[ Last edited by zhangmt on 2009-12-9 at 23:56 ]
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
13楼2009-12-09 23:54:14
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holysong

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2009-12-9 23:54:
qstn方法中,所有原子必须一一对应,把你的文件拆开看看就知道你的编号错位了。
你本意是6号氧上的14号H迁移到3号C上,可是你的产物中,14号H跑到4号C上了,
顶掉了13号H,而13号H顶掉了12号H,被顶掉的12号H迁 ...

谢谢,的确是编号出错,已经改了。。。
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14楼2009-12-10 21:07:11
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