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【求助】g09中连续计算的命令行如何写?
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| 在g09的用户手册和例子中经常看到是一个简单的分子(比如水、乙烷等)优化构型,接着计算单点能什么的。我的问题是:这两步计算是共用一个分子说明部分,还是第一步计算的结果作为第二步计算的分子说明部分?如果我想将第一步计算的结果作为第二步计算的分子说明部分,第二步计算结果作为第三步的分子说明部分,第三步计算结果作为第四步计算的分子说明部分,并且每一步计算中的电荷数和自旋多重度要自己定义,每一步的计算结果都要写在输出文件中(也就是.log中)以方便最后使用gview查看结果,命令行应该如何写?同时如何用gview查看每一步的计算结果也是个问题?另外,听人说g09不稳定,这种连续计算要是中间某一步出错,整个计算就会终止,如何避免?希望大家能够耐心点给出命令行的写法及注意事项,不要一个--link1--命令行就了事,其实这里面有很多说道及注意事项的,用户手册和例子中也没有明确地说明,需要大家给出自己的使用心得与经验,谢谢大家! |
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xtdut(金币+2,VIP+0):谢谢王大哥的回复!我会努力学习linux的,真是太感谢您了! 11-29 11:49
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-30 14:17
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mkdir step1 step2 step3 step4 mv /somewhere/jobname.com step1 cat job.list #! /bin/bash cd /somewhere/step1 g03 jobname.com wait cp jobname.chk jobname_step2.chk mv jobname_step2.chk ../step2 cd ../step2 g03 jobname_step2.com wait # write your command here # end of the file nohup sh job.list & #提交作业, 当然在中间,你可以写其他的指令,比如判定Log文件有么有收敛, 不收敛的,如何从那一步开始restart计算! 你可以自己些脚本来处理! 你的所有的问题,几乎都可以通过脚本处理 让所有的 计算自动处理! --link1--的方法,就是不能保留中间步骤的结果! 仔细看看 你想要的 都可以实现 就看你的水平了 |

3楼2009-11-29 11:45:23













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