24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 5960  |  回复: 78
【奖励】 本帖被评价58次,作者beefly增加金币 47.75
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

[资源] 【分享】加入了NBO5.G的Gaussian03模块

从国外某大学的计算服务器上找到的,已通过测试。原始程序是基于Gaussian 03 D.01源代码编译的,运行于AMD64 CentOS 5系统。

其他发布版的G03也可以正常使用。其他发布版的linux估计也没问题。除了AMD64 CPU外,Intel的EM64T(x86-64)或许也行,但我没试过。

使用方法:用解压缩后的l607.exe文件替换gaussian03原来的文件(之前最好做个备份,万一想用NBO 3.1版还可以改回来)。接下来,NBO 5.G的用法同Gaussian自带的NBO 3.1。5.G新增加的选项可以到NBO主页去找。

网上有人报告说,NBO 5.G和3.1的结果完全不一样,不过目前我还没遇到。或许是自己编译的程序有错误吧。大家也可以测试一下新旧NBO的结果有什么区别。

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 16:23 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯计算总结 Gaussian software 量化经验
量化 气态分子化学动力学 计算仿真

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtscrystal

银虫 (小有名气)


.................................略
******************************************
Gaussian 03:  AM64L-G03RevC.02 12-Jun-2004
                 3-Apr-2010
******************************************
%chk=nbo.chk
-----------------------------------------
#p opt hf/3-21g pop=npa geom=connectivity
-----------------------------------------
1/18=20,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=5,11=9,16=1,25=1,30=1/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1,40=-1/1,7;
7//1,2,3,16;
1/18=20/3(1);
99//99;
2/9=110/2;
3/5=5,11=9,16=1,25=1,30=1/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/18=20/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1,40=-1/1,7;
99/9=1/99;
Leave Link    1 at Sat Apr  3 18:45:11 2010, MaxMem=          0 cpu:       0.1
(Enter /opt/g03/l101.exe)
N-N= 1.766220028943D+02 E-N=-8.903652016048D+02  KE= 2.292897382171D+02
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.
Leave Link  601 at Sat Apr  3 18:45:30 2010, MaxMem=    6291456 cpu:       0.1
(Enter /opt/g03/l607.exe)

*********************************** NBO 5.G ***********************************
             N A T U R A L   A T O M I C   O R B I T A L   A N D           
             N A T U R A L   B O N D   O R B I T A L   A N A L Y S I S

*******************************************************************************
   (c) Copyright 1996-2008 Board of Regents of the University of Wisconsin System
       on behalf of the Theoretical Chemistry Institute.  All Rights Reserved.
           Cite this program as:
           NBO 5.G.  E. D. Glendening, J. K. Badenhoop, A. E. Reed,
           J. E. Carpenter, J. A. Bohmann, C. M. Morales, and F. Weinhold
           (Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin,
          Madison, WI, 2004); http://www.chem.wisc.edu/~nbo5
        /SKIPBO / : Skip NBO transformation step



Analyzing the SCF density

Job title: Title Card Required                                             

Storage needed:       18903 in NPA (     6291456 available)


NATURAL POPULATIONS:  Natural atomic orbital occupancies

1\1\GINC-IBBNODE1\FOpt\RHF\3-21G\C4H8O1\CATALYST\03-Apr-2010\0\\#P OPT
  HF/3-21G POP=NPA GEOM=CONNECTIVITY\\Title Card Required\\0,1\C,0.1997
055124,-1.9903423596,0.0848430549\H,0.0581896518,-2.0293559813,1.15692
98344\H,1.2645192507,-1.9620968528,-0.1056020982\H,-0.2091938275,-2.89
24457115,-0.3538971363\C,-0.4817655227,-0.7475130018,-0.5001226868\H,-
0.3500733821,-0.7081345283,-1.5780897596\H,-1.5529080557,-0.7751967263
,-0.3189418221\C,0.0669671758,0.5372968544,0.0925997812\C,-0.554890790
2,1.815247446,-0.433676707\H,-1.6225892391,1.8191209078,-0.2404176578\
H,-0.0976718698,2.6667733927,0.0489514086\H,-0.4116726324,1.8867373707
,-1.506866267\O,0.9426627315,0.5383080619,0.9295091055\\Version=AM64L-
G03RevC.02\State=1-A\HF=-229.7093496\RMSD=5.439e-09\RMSF=5.392e-06\Dip
ole=-0.8544522,-0.0053281,-0.8168266\PG=C01 [X(C4H8O1)]\\@


EDUCATION DOESN'T COST
           ... IT PAYS!

-- POSTMARK, UNIV. OF MISSISSIPPI, DEC 78
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 18.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     17 Int=      0 D2E=      0 Chk=     10 Scr=      1
Normal termination of Gaussian 03 at Sat Apr  3 18:45:30 2010.


这才是正解的NBO 5.G for INTEL series! including emt64 xeon

[ Last edited by wtscrystal on 2010-4-11 at 11:03 ]
19楼2010-04-11 10:59:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 79 个回答

greatqi

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢了,先下来测试下。
5楼2009-10-23 15:17:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlding

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

为什么要压缩那么多次~~~
6楼2009-10-23 15:54:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢beerfly每次都带来优秀的资源。
10楼2009-10-24 08:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见