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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

[交流] PCR反应两条引物Tm值相差很多怎么办?

PCR反应时,两条引物Tm值相差很多。大家都是怎么选择的?选择中间值还是怎样?谢谢各位!
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

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Originally posted by zhaocy8903 at 2009-10-19 09:31:
按低的算

按 低的Tm-5吗?
3楼2009-10-19 09:35:19
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hihoney at 2009-10-19 10:18:
P一下试试,不能P出来就重新设计了。

初次做,感觉还是蛮担心的
5楼2009-10-19 10:22:24
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by bioxixi at 2009-10-19 10:29:
你的引物就这样了 有什么办法了
你最好说出各是多少度 很多是多少啊
从低的开始了,要是很低就+2度,要是不是很低就先-5,然后每次+2递增,试试看

分别是73  93----
8楼2009-10-19 10:31:37
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zrb7858 at 2009-10-19 10:25:
可以降落PCR扩

打算这么做,可以指点一下么?额没做过----
10楼2009-10-19 10:35:17
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jjlbest at 2009-10-19 10:34:
是按低的那个引物来进行,退火温度可以在TM值的上下5度浮动。

谢谢!要不我就这么先p一下试试!
11楼2009-10-19 10:36:40
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2009-10-19 10:59:

Tm好高啊,都快变性温度了,用68试试看。

是做的重叠延伸PCR. 为啥是68,能说说理由吗?万分感谢!
13楼2009-10-19 11:17:15
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 1949stone at 2009-10-19 12:04:
比最低的低五度

额  汗   这个都没看出来  太不好意思了  谢谢哈
15楼2009-10-19 12:21:30
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhuifeng7000 at 2009-10-19 17:08:
其实我觉得影响不大,每次我都不按照Tm值PCR都,一般都用55℃拉,一般都可以拉的出来,不行的话就降低一下退火温度。

啊?这么简单?我以前也做过普通的PCR,很麻烦哪!  

再说我的是一个73 一个93 , 55的话感觉很悬,我明天试试再向大家汇报吧
17楼2009-10-19 17:19:13
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彩云朵朵

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by l_inhumain at 2009-10-19 22:53:
我觉得很多时候由于引物的设计受到模板的控制,腾挪余地并不大,有些tm值相差很大,与引物设计规则差异也会很大,但大多数情况还是能够P出条带来的,不用太担心。设计的引物与规则越相符只能说明P出来的条带会好看 ...

哦  呵呵  真是太感激了!
21楼2009-10-20 09:06:20
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