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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】氢键的问题
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tpanzhang99

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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-16 22:11
引用回帖:
Originally posted by caohuiming at 2009-10-14 20:56:
怎样知道两个化合物之间是否能形成分子间氢键？？？是用算弱相互作用形成分子间氢键的产物的能量E（A+B）-E（A）-E（B）的值吗？？？还是用其他方法判断啊？

按照“E（A+B）-E（A）-E（B）”这样的算法严格来说应该叫两者间的结合能，但有的文献认为结合能就可以等于氢键的能量，特别是只有上述A，B两种物质的时候。如有其它的物质影响，这样计算有可能不太正确，因为氢键是静电相互作用，共价作用，电子转移等多种作用的结果。
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11楼2009-10-15 16:47:52
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
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yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 10-16 13:01
引用回帖:
Originally posted by caohuiming at 2009-10-15 09:04:

能具体说一下aim吗  是计算软件还是计算方法

AIM （atom in molecular thoery），performed by AIM2000 program，
There is one BCP （bond critical point）between each pair of atoms that are bonded，The strength of a chemical bond, its bond order (BO), is reflected in the electron density at the BCP  rb . In general, rb is greater than 0.20 au in shared (covalent) bonding and less than 0.10 au in a closed-shell interaction (for example ionic, van der Waals, hydrogen, dihydrogen, H-H bonding, etc.). rb has been shown to be strongly correlated with the binding energy for several types of bonding interaction. Also,The Laplacian at the BCP is the sum of the three curvatures of the density at the critical point, In covalent bonding the two negative curvatures are dominant and ‘Laplacian < 0, In contrast, in closed-shell
bonding, for example ionic, hydrogen-bonding or van der Walls interactions, the
interaction is characterized by Laplacian> 0.
further information can be got from the book of of Atoms in Molecules > by Che´rif F. Matta and Russell J. Boyd
3Q!

[ Last edited by 半支烟5591 on 2009-10-15 at 19:35 ]
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12楼2009-10-15 19:22:23
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sshadow

铁虫 (初入文坛)
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yjcmwgk(金币+4,VIP+0):谢谢。这个aim免费不？ 10-16 13:02
分子中的原子理论AIM在研究分子之间的弱相互作用及其成键信息方面有其独特的优越性. 利用AIM理论进行弱相互作用的研究时, 涉及到3个重要参数及8个拓扑指标. 参数一: 键鞍点的电子密度ρ(rc), 它与键的强弱正相关, ρ(rc)越大(小), 键的强度越强(弱); 参数二: 键鞍点处的拉普拉斯量∇2ρ(rc), 它反映了键的性质, 离子型键具有∇ 2ρ(rc)>0的特点, 而如果∇2ρ(rc)<0, 则表明该键是共价型; 参数三: 椭圆度ε (ε = λ1/λ2−1), 它定性描述了键的σ或π键特性, ε 越大说明化学键的π性越强, ε → 0说明化学键是典型的 σ 键. 当用AIM理论判断分子间是否有氢键存在时, Popelier提出了8个拓扑指标作为判据, 其中较重要的有: (1) 在成键原子之间存在键径及键鞍点BCP; (2) BCP处ρ(rc)的值在0.002~0.034 a.u.之间; (3) BCP处∇2ρ(rc)的值在0.024~0.139 a.u.之间等.

下个AIM2000好好研究下吧
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13楼2009-10-16 00:11:53
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mengfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by sshadow at 2009-10-16 00:11:
分子中的原子理论AIM在研究分子之间的弱相互作用及其成键信息方面有其独特的优越性. 利用AIM理论进行弱相互作用的研究时, 涉及到3个重要参数及8个拓扑指标. 参数一: 键鞍点的电子密度ρ(rc), 它与键的强弱正相关, ...

这是免费的吗？
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14楼2009-10-16 17:53:16
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sshadow

铁虫 (初入文坛)
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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-18 13:22
AIM这个理论当然是免费的，软件的话流行的是AIM2000 V1.0免费 2.0是商用收费的了，要是不画图，还是免费的AIMALL
引用回帖:
Originally posted by mengfc at 2009-10-16 17:53:

这是免费的吗？

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15楼2009-10-17 22:28:30
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