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zxdai

金虫 (正式写手)


[资源] 【原创】siesta 3.0成功编译的arch.make

相信很多虫虫拿到SIESTA 3.0,我也一样。在maillist得到消息后,我下载下来并进行了编译。虽然3.0比以前的2.0系列要好编译一些,但还不是那么特别容易编译。比如:transport的模块的编译。 我现在把transport的模块的编译的arch.make文件贴出来供大家参考。因为siesta的编译相对简单。



#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M.Soler, 1996-2006.
#
# Use of this software constitutes agreement with the full conditions
# given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users.
#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--Portland

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=cpu_time

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-tp penryn-64,k8-64e  -fast
FPPFLAGS= -DMPI -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DTRANSIESTA
LDFLAGS=

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

#BLAS_LIBS=-lblas
#LAPACK_LIBS=-llapack
#BLACS_LIBS=
#SCALAPACK_LIBS=
BLAS_LIBS=$(MKL_LIB_DYN_SEQ)
LAPACK_LIBS=
BLACS_LIBS=$(MKL_LIB)/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a
SCALAPACK_LIBS=-L$(MKL_LIB) -lmkl_scalapack_lp64

COMP_LIBS=

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=.

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<


编译的基本原则是:

用相同的编译器(包括编译器种类和版本)来编译mpi以及各种数据库scallapck等。

比如我用的的mpi和编译器是 openmpi和pgi 8.0.4

which  mpif90 是:

/share/openmpi/1.3.3/x86_64/pgi-8.0-4/bin/mpif90

[ Last edited by zxdai on 2009-10-7 at 00:07 ]
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引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-10-06 12:56:08:
我用2.02的arch.make编译3.0的并行版本的时候却是不行。
另外用intel编译器编译的openmpi来编译2.02并行版也是不行,用mpich2很顺利。
不过我用的是libgoto的blas

你的这个arch.make里
MKL_LIB_DYN_SEQ,MK ...

我用的ifort-10.0,openmpi-1.2.6,mkl-10.2可以编译siesta-2.0.2和siesta-3.0-b啊!
22楼2010-04-03 23:42:06
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

强烈支持
2楼2009-10-06 09:29:14
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)


引用回帖:
Originally posted by zxdai at 2009-10-5 13:09:
相信很多虫虫拿到SIESTA 3.0,我也一样。在maillist得到消息后,我下载下来并进行了编译。虽然3.0比以前的2.0系列要好编译一些,但还不是那么特别容易编译。比如:transport的模块的编译。 我现在把transport的模 ...

听说这个软件新版本可以加磁场算输运性质吗?能否开贴给个这个软件的功能的介绍?
3楼2009-10-06 09:30:15
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fuzp

铁杆木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

我用2.02的arch.make编译3.0的并行版本的时候却是不行。
另外用intel编译器编译的openmpi来编译2.02并行版也是不行,用mpich2很顺利。
不过我用的是libgoto的blas

你的这个arch.make里
MKL_LIB_DYN_SEQ,MKL_LIB是事先有定义吧。

[ Last edited by fuzp on 2009-10-6 at 13:00 ]
6楼2009-10-06 12:56:08
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