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guosy1999木虫 (正式写手)
中纪委反2协会督导员
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[交流]
【求助】NVT系综下动力学平衡、均方位移的紊乱
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在用MS中的discover模块计算动力学均方位移时，步长1fs，动力学时间1500ps,平衡时间500ps，温控方法为Nose法。。动力学之前结构已minimizer过了，但是anaylsis时，MSD曲线呈现波浪式变化（如附件图），没有一点直线的迹象。。该怎么办呢？是由于动力学没有达到平衡吗？该改变什么参数。。谢谢！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 10:10 ] |
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