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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员

[交流] 【求助】NVT系综下动力学平衡、均方位移的紊乱

在用MS中的discover模块计算动力学均方位移时,步长1fs,动力学时间1500ps,平衡时间500ps,温控方法为Nose法。。动力学之前结构已minimizer过了,但是anaylsis时,MSD曲线呈现波浪式变化(如附件图),没有一点直线的迹象。。该怎么办呢?是由于动力学没有达到平衡吗?该改变什么参数。。谢谢!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 10:10 ]
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少年不识愁滋味,为赋新词强说愁。
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-26 10:10
像是小分子在一个6A 左右的球形空腔,跑不出来了.
14楼2009-11-24 19:11:31
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