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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

[交流] 第一性原理程序使用频度统计(2021)

论坛内上一次统计这个问题可能是在2014年,时隔多年,有更多的程序可以被用于模拟研究供大家选择。本次统计原则上只包含Kohn-Sham框架下的求解引擎,半经验方法和激发态处理如DFTB和BGW等暂时不计入其中,其他的前后处理接口程序和图形显示程序如ASE和XCrysDen也不包含,更多没有被包含的程序大家也可以补充在帖子中。本次统计的目的是为了能够让大家更方便交流以及认识不同程序擅长解决的问题、算法上的优势,也欢迎跟帖交流讨论。
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
20楼: Originally posted by 泡泡媛 at 2023-12-09 15:39:11
好的,有时间我看下,笑死,这个帖子已经是两年前了...

笑死,你看他那个文章里面跑十万原子啥配置,再一个就是如果要做结构优化有什么问题(结论之前的一段)。
事实上DFT-FE(基于有限元基组)基本上也能做到一个数量级,上面GB prize有具体数据,并且功能方面没什么严重缺陷。国内也有程序入围过,有兴趣你可以关注上面GB prize文章Large-scale materials modeling at quantum accuracy: Ab initio simulations of quasicrystals and interacting extended defects in metallic alloys的引文37。
虽然我个人看法而言,P级或E级计算那些技术其实一般小的课题组还是很难用得上,几百至几千原子范围内能有很好的性价比就不错,再大的体系算不动的不只是电子结构方面,构象采样等等一系列事情就不太可以忽略了。
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21楼2023-12-16 09:00:49
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

迄今,我个人最常使用的主要还是Quantum Espresso(QE)、DMol3。

QE的主要模块pw.x是基于赝势平面波框架的程序,赝势支持PSLib的超软赝势和PAW、GBRV超软赝势、ONCV框架的SG15和Dojo模守恒赝势,这些赝势的精度相对而言都比较高,QE允许这些赝势/PAW混合使用。QE处理二维体系比较友好,对于边界处理,外加电荷或者表面存在偶极矩的情况有专门的修正方法,也支持恒Fermi能级的计算。Hubbard模型支持各向同性的DFT+Ueff以及非各项同性的DFT+U+J以及考虑位点间排斥的DFT+U+V模型。后处理分析中支持RDG和ELF等(6.7之前的某些版本可能有bug,我和朋友已经向官方提交了修正版本),还有DFPT支持多q点计算声子谱。缺点当然也有,比如算法比较单一,迭代算法中可调的参数比较少,部分功能可能只支持模守恒赝势(如MetaGGA),溶剂化插件Environ相对来说也不那么好用,经常跟不上版本。

平面波基组尺寸要比原子轨道基组大很多,稍大一些尺寸的体系还是LCAO更快。不管原子相同不相同,或者这个位置有没有原子,平面波方法都一视同仁加上等间距的积分网格,比如表面上吸附个长链的分子或者纳米线亦或是分子的积分平面波效率要低很多。
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2楼2021-05-01 08:39:06
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涪东耳

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
居然只有我一个用全势方法,难以置信。

发自小木虫Android客户端
3楼2021-05-24 03:08:20
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by 涪东耳 at 2021-05-24 03:08:20
居然只有我一个用全势方法,难以置信。

应该不会,ELK我也用过一段时间,不过现在折腾偏少。
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4楼2021-06-04 19:41:05
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