| 查看: 3316 | 回复: 11 | ||||
| 【奖励】 本帖被评价8次，作者顺水增加金币 6.4 个 | ||||
[资源]
【转帖】PBS安装
|
||||
|
PBS是功能最为齐全，历史最悠久，支持最广泛的本地集群调度器之一。 PBS的目前包括openPBS，PBS Pro和Torque三个主要分支。 其中OpenPBS是最早的PBS系统，目前已经没有太多后续开发，PBS pro是PBS的商业版本，功能最为丰富。Torque是Clustering公司接过了OpenPBS，并给与后续支持的一个开源版本。 下面是本人安装torque的过程。 一、Torque安装 在master（管理结点上） 1、解压安装包 [root@master tmp]# tar zxvf torque-2.3.0.tar.gz 2、进入到解压后的文件夹 ./configure --with-default-server=master make make install 安装完成后，将torque文件夹中的bin、sbin加入到环境变量中 3、 （1）[root@master torque-2.3.0]#./torque.setup （2）[root@master torque-2.3.0]#make packages 把产生的 tpackages , torque-package-clients-linux-x86-64.sh, torque-package-mom-linux-x86-64.sh 拷贝到所有节点。 （3）[root@master torque-2.3.0]# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh --install [root@master torque-2.3.0]# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --install （4）编辑/var/spool/torque/server_priv/nodes （需要自己建立） 加入如下内容 master np=4 node01 np=4 ....... node09 np=4 （5）启动pbs_server,pbs_sched,pbs_mom,并把其写到/etc/rc.local里使其能开机自启动。 （6）创建队列 [root@master ~]# qmgr create queue students set queue students queue_type = Execution set queue students Priority = 40 set queue students resources_max.cput = 96:00:00 set queue students resources_min.cput = 00:00:01 set queue students resources_default.cput = 96:00:00 set queue students enabled = True set queue students started = True 4、在node0x （x=1-9,计算结点上） [root@node0x torque-2.3.0]# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh --install [root@node0x torque-2.3.0]# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --install 然后启动pbs_mom ,把pbs_mom写入/etc/rc.local 二、Torque PBS使用 1、创建用户 在master的root下 useradd test passwd test 输入test密码 到/var/yp下make一下 2、配置普通用户的ssh su test cd ssh-keygen -t dsa cd .ssh cat id_pub.dsa >>authorized_keys chmod 600 authorized_keys 3、编写作业脚本 [test1@master t]vi pbsjob #!/bin/tcsh #PBS -o /home/test1/pbstest/t/output 标准输出文件 #PBS -e /home/test1/pbstest/t/error 错误输出文件 #PBS -l nodes=5:ppn=4 规定使用的节点数以及每个节点能跑多少核 #PBS –q students 把任务提交到students队列中 cd $PBS_O_WORKDIR 到工作目录下（此为PBS提供的环境变量） mpirun –machine $PBS_NODEFILE -np 20 ./vasp 4、启动mpd mpdboot -n 10 -f mfa mfa内容： master:4 node01:4 …. node09:4 5、提交，查询，删除作业 提交作业：qsub pbsjob 作业提交后会有一个作业号 [test1@master pbstest]$ qsub pbsjob 48.master 查询作业：qstat [test1@master pbstest]$ qstat Job id Name User Time Use S Queue ------------------------- ---------------- --------------- -------- - ------------------------------- 48.master pbstest test1 00:00:00 R students 删除作业：qdel 作业号 [test1@master pbstest]$ qdel 48 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 有效质量 |
» 猜你喜欢
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有10人回复
-
基金系统什么内容也没有
已经有7人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有18人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有12人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- PBS脚本的编写问题
已经有15人回复
- 作业管理系统Torque 2.4.16在Linuxmint 13 / Ubuntu12.04工作站/单机上的安装和使用
已经有9人回复
- 关于linux下的任务管理软件比如PBS
已经有10人回复
- PBS-torque安装问题，求教一下，谢谢~~~
已经有10人回复
- Linux集群rocks的安装和SGE管理调度MS5.5作业
已经有16人回复
- 求一个WIEN2k服务器计算的Pbs提交命令文件
已经有4人回复
- 采用PBS脚本第一次提交任务，算了1步就被杀死，有错误提示但不知道原因？
已经有19人回复
- PBS脚本如何编译？
已经有5人回复
- 求：用PBS脚本提交MS任务具体步骤
已经有4人回复
- 求助PBS的配置
已经有7人回复
- PBS下同一用户同时使用不同版本的Gaussian的方便做法
已经有7人回复
- 如何在计算机群上安装G09
已经有9人回复
- PBS中资源的选择#PBS -l nodes=...
已经有5人回复
- PBS 主服务无法启动
已经有8人回复
- 如何编写PBS作业的脚本？
已经有14人回复
- 请教ORCA的并行及集群上的脚本文件
已经有14人回复
- 【求助/交流】PBS缓冲液用什么来调ph值呢？
已经有30人回复
- 【讨论】PC-cluster的管理
已经有13人回复
3楼2011-04-09 21:20:48
5楼2011-05-25 17:02:59
6楼2012-01-05 20:29:32
7楼2013-05-12 18:26:21
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
|
本帖内容被屏蔽 |
8楼2013-06-21 20:16:26
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2013-06-21 20:18:57
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
|
本帖内容被屏蔽 |
10楼2013-06-21 20:24:48
11楼2013-12-09 18:09:51
12楼2016-01-17 17:41:25
简单回复
wuli82楼
2009-08-21 16:14
回复
2011-04-09 22:03
回复
五星好评 
30
