24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2585  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fengzheng770

铜虫 (初入文坛)

[交流] 为什么查到的cDNA序列PolyA后面还会有序列?已有5人参与

为什么在genbank数据库查到的cDNA序列有些在polyA后面还有序列,不是本身mRNA就是以polyA结束的吗?反转录时引物是oligo(dt)?怎么会出现序列?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xumin-0120

铁虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-02-24 11:56:16
我刚才找到我的原因了,我的是3’race 的内侧引物序列,所得测序都含有,PCR产物测序结果也存在这个引物的序列,看看你是不是这个情况~
13楼2011-02-24 11:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)

3' UTR 是应该在poly A tail之前的。有多长?
3楼2009-08-03 07:57:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengzheng770

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by michaelwuqingyu at 2009-8-3 07:57:
3' UTR 是应该在poly A tail之前的。有多长?

大概长50多,查到的mRNA序列也不太一致,polyA后面的序列有长有短。

如AF141379 ,在AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面有一段序列,然后又是AAAAAAAAAAAAAAAA,经和同源序列比较,第一个AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面就应该结束了,而后面的序列和AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA是什么?
ATCCAGCCTCCAAAATGATCCAAGTTCTCTTGGTAACCATATGCTTAGCAGCTTTTCCTTATCAAGGGAG
CTCTATAATCCTGGAATCTGGGGACGTGAATGATTATGAAGTAGTCTATCCACGAAAAGTCACTGCATTG
CCCAAAGGAGCAGTTCAGCAAAAGTATGAAGACGCCATGCAATATGAATTTAAAGTGAATGGAGAGCCAG
TGGTCCTTCACCTGGAAAAAAATAAACATCTTTTTTCAAAAGATTACAGCGAGACTCATTATTCCCCTGA
TGGCAGAGAAATTACAATAAACCCTCCGGTTGAGGATCACTGCTATTATCATGGACGCATCGAGAATGAT
GGTGACTCAACTGCAAGCATCAGTGCATGCAATGGTTTGAAAGGAAATTTCAAGCTTCAAGGGGAGACGT
ACCTTATTGAACCCATGAAGCTTTCTGACAGTGAAGCCCATGCAGTCTTCAAATATGAAAATGTAGAAAA
AGATGAGGCCCCCAAAATGTGTGGGGTAACCCAGAAGTGGAAATCATATGAGCCCATCAAAAAGATCTCT
CAGTTAAATCTTATTCCTGAACAACAAATCTATGACCCCTTCAAATACGTTGAGACTGTCGTTGTTGTGG
ACAAAGCAATGGTCACAAAATACAATGGCGATTTAGATAAGATAATAACAAAAATGTACGAAGCTGCCAA
CAATATGAATGAGATGTACAGATATATGTTTTTTCGTGTAGTAATGGTTGGCCTAATAATTTGGACCGAA
GAAGATAAGATTACCGTGAAGCCAGATGTGGATTATACTTTGAACGCATTTGCAGAATGGAGAAAAACAT
ATTTGCTGGCTGAGAAAAAACATGATAATGCTCAGTTAATCACGGGCATTGACTTCCGAGGAAGCATTAT
AGGATACGCTTACATTGGCAGCATGTGCCACCCGAAGCGTTCTGTAGGAATTATTCAGGATTATAGCCCA
ATAAATCTTGTGCTTGCCGTTATAATGGCCCATGAGATGGGTCATAATCTGGGCATACATCATGACGACG
GTTACTGTTATTGCGGTGGTTACCCATGCATTATGGGTCCCTCGATAAGCCCTGAACCTTCCAAATTTTT
CAGCAATTGTAGTTATATCCAATGTTGGGACTTTATTATGAATCACAACCCAGAATGCATTGACAATGAA
CCCTTGGGAACAGATATTATTTCACCTCCACTTTGTGGAAATGAACTTTTGGAGGTGGGAGAAGAATGTG
ACTGTGGCACTCCTGAAAATTGTCAAAATGAGTGCTGCGATGCTGCAACGTGTAAACTGAAGTCAGGGTC
ACAGTGTGGACATGGAAAATGTTGTGAGCAATGCAAATTTAGGACATCAGGAACAGAATGCCGGGCATCA
ATGAGTGAATGTGACCCAGCTGAACACTGCACTGGCCAATCTTCTGAGTGTCCTGCAGACGTCTTCCATA
AGAATGGGGAACCATGCCTAGATAACTACGGTTACTGCTACAATGGGAATTGCCCCATCATGTATCACCA
ATGTTATGCTCTCTTTGGTGCAGAAGTTTATGAGGCTGAAGATTCATGTTTTGAGAGTAACAAGAAAGGC
AATTATTATGGCTACTGCAGAAAGGAAAATGGTAAAAAGATTCCATGTGCATCAGAAGATGTAAAATGTG
GCAGGTTATACTGCAAAGATGATTCACCTGGACAAAATAATCCTTGCAAGATGTTCTATTCCAATGACGA
TGAACATAAGGGAATGGTTCTTCCTGGAACAAAATGTGCAGATGGAAAGGTCTGCAGCAACGGGCATTGT
GTTGATGTGACTACAGCCTACTAGTCAACCTCTGGCTTTGATTTTGGAGATCCTCCTTCCAGAAGGTTTG
GCTTCTCTCAAGTCCAAAGAGATCCATCTGCCTGTATCTTACTAGTAAATCACCCTTAGCTTCCAGATGG
CATCCAAATTCAGCAATATTTCTTCACCATATTTAATCTGTTTACCTTTTGCTGTAATCAAACCTTTTCC
CCACCACAAAGCTCCATGGGCATGTACAACACACCAAGGGCTTATTTGCTGTCAAGAAAAAAATGGCCAT
TTTACCATTTGCCAATTGCAGAGCACATTTAATACAACAAGTTCTGCCTTTTGAGCTGGTGTATTCGAAG
TCAATGCTTCCTCTTCCAAACTTTTGTGCTGGCTTTCCAAGATGTAGCTGCTTCCATCAATAAACTATTT
TCATTCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTACTTTGATGTGATGCTGTG
CAAGCAAGGTATCACAGATGTAAAAGCAGCTTTGGTGGTCGAAATATCTGTCTGCAGGGGAAACACGAAA
CATTCCTTGTTTACTGAACCAGATTTGCAGCCTTCCGGATACTAACAGTCTCTTATGTCTCTGATTGTTT
CAGTTTGTAAAGAGAAGCTTTTAAAAGAAATCCTTAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAA
4楼2009-08-04 18:07:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengzheng770

铜虫 (初入文坛)

有没有人知道?帮忙解答,谢谢谢谢
5楼2009-08-05 09:18:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见