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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 为什么查到的cDNA序列PolyA后面还会有序列？
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fengzheng770

铜虫 (初入文坛)

[交流] 为什么查到的cDNA序列PolyA后面还会有序列？已有5人参与

为什么在genbank数据库查到的cDNA序列有些在polyA后面还有序列，不是本身mRNA就是以polyA结束的吗?反转录时引物是oligo（dt）？怎么会出现序列？
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1楼2009-08-02 22:30:42
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cdl007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
silicare(金币+2): 谢谢参与 2011-02-24 11:55:40
我认为mRNA说有polyA尾巴，但是没说具体有多少个A，为什么？
polyA后面还有序列，明显是终止子以外的序列，为什么？

因为polyA尾巴，是人们对它的认识，对它的命名，实际的生物现象应该是mRNA到了polyA的位置，就不稳定了，极容易断掉，或者降解，这种现象很可能是随机的，所以polyA的数量也不一定，杂序列也许会存在，这些序列也许本身没有意义，也许在进化过程中曾经有意义，但是现在无意义了，细胞进化没有来得及（或者没有必要）再消除这些无意义的序列

当然话不能绝对，也许以后研究这些序列也有调控功能也未必
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11楼2011-02-24 10:15:56
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michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)
3' UTR 是应该在poly A tail之前的。有多长？
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3楼2009-08-03 07:57:07
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fengzheng770

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by michaelwuqingyu at 2009-8-3 07:57:
3' UTR 是应该在poly A tail之前的。有多长？

大概长50多，查到的mRNA序列也不太一致，polyA后面的序列有长有短。

如AF141379 ，在AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面有一段序列，然后又是AAAAAAAAAAAAAAAA，经和同源序列比较，第一个AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA后面就应该结束了，而后面的序列和AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA是什么？
ATCCAGCCTCCAAAATGATCCAAGTTCTCTTGGTAACCATATGCTTAGCAGCTTTTCCTTATCAAGGGAG
CTCTATAATCCTGGAATCTGGGGACGTGAATGATTATGAAGTAGTCTATCCACGAAAAGTCACTGCATTG
CCCAAAGGAGCAGTTCAGCAAAAGTATGAAGACGCCATGCAATATGAATTTAAAGTGAATGGAGAGCCAG
TGGTCCTTCACCTGGAAAAAAATAAACATCTTTTTTCAAAAGATTACAGCGAGACTCATTATTCCCCTGA
TGGCAGAGAAATTACAATAAACCCTCCGGTTGAGGATCACTGCTATTATCATGGACGCATCGAGAATGAT
GGTGACTCAACTGCAAGCATCAGTGCATGCAATGGTTTGAAAGGAAATTTCAAGCTTCAAGGGGAGACGT
ACCTTATTGAACCCATGAAGCTTTCTGACAGTGAAGCCCATGCAGTCTTCAAATATGAAAATGTAGAAAA
AGATGAGGCCCCCAAAATGTGTGGGGTAACCCAGAAGTGGAAATCATATGAGCCCATCAAAAAGATCTCT
CAGTTAAATCTTATTCCTGAACAACAAATCTATGACCCCTTCAAATACGTTGAGACTGTCGTTGTTGTGG
ACAAAGCAATGGTCACAAAATACAATGGCGATTTAGATAAGATAATAACAAAAATGTACGAAGCTGCCAA
CAATATGAATGAGATGTACAGATATATGTTTTTTCGTGTAGTAATGGTTGGCCTAATAATTTGGACCGAA
GAAGATAAGATTACCGTGAAGCCAGATGTGGATTATACTTTGAACGCATTTGCAGAATGGAGAAAAACAT
ATTTGCTGGCTGAGAAAAAACATGATAATGCTCAGTTAATCACGGGCATTGACTTCCGAGGAAGCATTAT
AGGATACGCTTACATTGGCAGCATGTGCCACCCGAAGCGTTCTGTAGGAATTATTCAGGATTATAGCCCA
ATAAATCTTGTGCTTGCCGTTATAATGGCCCATGAGATGGGTCATAATCTGGGCATACATCATGACGACG
GTTACTGTTATTGCGGTGGTTACCCATGCATTATGGGTCCCTCGATAAGCCCTGAACCTTCCAAATTTTT
CAGCAATTGTAGTTATATCCAATGTTGGGACTTTATTATGAATCACAACCCAGAATGCATTGACAATGAA
CCCTTGGGAACAGATATTATTTCACCTCCACTTTGTGGAAATGAACTTTTGGAGGTGGGAGAAGAATGTG
ACTGTGGCACTCCTGAAAATTGTCAAAATGAGTGCTGCGATGCTGCAACGTGTAAACTGAAGTCAGGGTC
ACAGTGTGGACATGGAAAATGTTGTGAGCAATGCAAATTTAGGACATCAGGAACAGAATGCCGGGCATCA
ATGAGTGAATGTGACCCAGCTGAACACTGCACTGGCCAATCTTCTGAGTGTCCTGCAGACGTCTTCCATA
AGAATGGGGAACCATGCCTAGATAACTACGGTTACTGCTACAATGGGAATTGCCCCATCATGTATCACCA
ATGTTATGCTCTCTTTGGTGCAGAAGTTTATGAGGCTGAAGATTCATGTTTTGAGAGTAACAAGAAAGGC
AATTATTATGGCTACTGCAGAAAGGAAAATGGTAAAAAGATTCCATGTGCATCAGAAGATGTAAAATGTG
GCAGGTTATACTGCAAAGATGATTCACCTGGACAAAATAATCCTTGCAAGATGTTCTATTCCAATGACGA
TGAACATAAGGGAATGGTTCTTCCTGGAACAAAATGTGCAGATGGAAAGGTCTGCAGCAACGGGCATTGT
GTTGATGTGACTACAGCCTACTAGTCAACCTCTGGCTTTGATTTTGGAGATCCTCCTTCCAGAAGGTTTG
GCTTCTCTCAAGTCCAAAGAGATCCATCTGCCTGTATCTTACTAGTAAATCACCCTTAGCTTCCAGATGG
CATCCAAATTCAGCAATATTTCTTCACCATATTTAATCTGTTTACCTTTTGCTGTAATCAAACCTTTTCC
CCACCACAAAGCTCCATGGGCATGTACAACACACCAAGGGCTTATTTGCTGTCAAGAAAAAAATGGCCAT
TTTACCATTTGCCAATTGCAGAGCACATTTAATACAACAAGTTCTGCCTTTTGAGCTGGTGTATTCGAAG
TCAATGCTTCCTCTTCCAAACTTTTGTGCTGGCTTTCCAAGATGTAGCTGCTTCCATCAATAAACTATTT
TCATTCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTACTTTGATGTGATGCTGTG
CAAGCAAGGTATCACAGATGTAAAAGCAGCTTTGGTGGTCGAAATATCTGTCTGCAGGGGAAACACGAAA
CATTCCTTGTTTACTGAACCAGATTTGCAGCCTTCCGGATACTAACAGTCTCTTATGTCTCTGATTGTTT
CAGTTTGTAAAGAGAAGCTTTTAAAAGAAATCCTTAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAA
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4楼2009-08-04 18:07:26
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fengzheng770

铜虫 (初入文坛)
有没有人知道？帮忙解答，谢谢谢谢
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5楼2009-08-05 09:18:37
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