24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 438  |  回复: 15
当前主题已经存档。

michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-1 09:32
你的cDNA 序列有多长?
如果cDNA序列很短的话,你有可能没能够得到全长的cDNA序列,
如果cDNA序列很长,你用软件预测出这个结果,肯定是有问题,因为生物体不会产生那么多垃圾序列来浪费能量。
你还可以试一下tBLASTn,和blastx。如果你的cDNA序列很长,有可能你的序列发生突变,产生终止密码子。 我认为最大的可能性是你没有得到全长的cDNA序列
11楼2009-07-30 10:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cularmy

新虫 (初入文坛)

用ORF finder预测,最长的那个就是你基因的ORF.
12楼2009-07-30 12:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wencul

铁杆木虫 (著名写手)

Metagross

谢谢

cDNA 序列长度只有460多bp
RACE试验的结果重复了很多次都是这么长的
引用回帖:
Originally posted by michaelwuqingyu at 2009/7/30 10:56:
你的cDNA 序列有多长?
如果cDNA序列很短的话,你有可能没能够得到全长的cDNA序列,
如果cDNA序列很长,你用软件预测出这个结果,肯定是有问题,因为生物体不会产生那么多垃圾序列来浪费能量。
你还可以试一下 ...

Metagross
13楼2009-07-31 21:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanshi

银虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-1 09:32
根据一个片段扩增一个猪的新基因

请问,你这个片段在NCBI上有同源序列吗?

如果没有,你这个片段是怎么来的?
14楼2009-07-31 23:12:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wencul

铁杆木虫 (著名写手)

Metagross

这个片段是前面师姐DDRT出来的,
没有其他同源性序列
引用回帖:
Originally posted by huanshi at 2009/7/31 23:12:
根据一个片段扩增一个猪的新基因

请问,你这个片段在NCBI上有同源序列吗?

如果没有,你这个片段是怎么来的?

Metagross
15楼2009-08-06 21:15:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shensc727

金虫 (小有名气)

纯属学习!!!帮顶
16楼2009-08-06 21:51:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wencul 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见