| 查看: 969 | 回复: 4 | ||
| 【奖励】 本帖被评价2次，作者neweroica增加金币 1.5 个 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
[资源]
【原创】Cartes 1.3.5 免费版【已搜无重】
|
||
|
小木虫上有人曾提供过Cartes的下载资源，但都不是最新版本的。这个特将Cartes 1.3.5 免费版传上来。 注：Windows Vista使用注意：将cartes.exe的兼容模式改成Windows XP，并从用“管理员运行模式”。 1、Cartes软件的功能： Cartes软件是对分子和晶体的结构进行编辑和操作的强大工具，它可以帮助人们解决在进行理论和计算化学研究时模型构造中所遇到的困难。下面我们将看到，Cartes有着许其他分子结构编辑软件所没有的功能和优点，如果能结合诸如Chem3D, GaussView等软件辅助使用，通常的分子结构构造都能轻松完成。总体来说，Cartes的功能有： （一）晶体坐标变换 (1)晶体的分数坐标转化成直角坐标。 (2)晶体的直角坐标转化成分数坐标。 (3)生成向ａ,ｂ,ｃ三个方向堆积i,j,k个晶胞的全部分数坐标或直角坐标。 (4)生成按照给定对称性关系得出的所有相关原子的分数坐标或直角坐标。 (5)按照空间群的对称性由不等价原子推出一个晶胞内所有原子的坐标。 (6)查看空间群信息，包括国际空间群符号，Schonflies标记，晶系，Wyckoff位置以及所有对称性等价位置等。 (7)自动转换*.cif文件：从*.cif文件中读取选定结构，然后自动将其转换成包含一个完整晶胞的坐标文件。 （二）分子坐标变换 (1)按照指定对称操作任意平移、旋转、反映或反演当前的坐标。 (2)将一组坐标的中心平移到原点。 (3)判断分子的点群，并显示主要对称元素（如旋转轴的轴向矢量，对称面的法向矢量等等）。 (4)自动调整分子取向，包括： 1)自动将分子的主轴调整到x,y,z轴上。 2)自动将分子的自定义的某个轴调整到自定义的另外一个轴上。 （三）各种文件格式的转换 (1)可导入的直角坐标文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) XYZ Coordinate (*.xyz) Brookhaven PDB Files (*.pdb,*.ent) Crystallographic Information Files (*.cif) MDL MOL Files (*.mol,*.sdf,*.sd,*.mdl) InsightII CAR Files (*.car)|*.car Cambridge Crystallographic (*.csd,*.fdat,*.dat) Quanta Files (*.msf) Sybyl MOL2 Files (*.mol2) Cerius2 Files (*.msi) Catalyst Files (*.cpd) Catalyst Query Files (*.chm) MDL Sketch (*.skc)|*.skc InsightII Grid Files (*.grd) DS ViewerPro Files (*.msv) (2)可导入的分数坐标文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) Crystallographic Information Files (*.cif) (3)可导出的直角坐标文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) XYZ Coordinate (*.xyz) Brookhaven PDB Files (*.pdb,*.ent) MDL MOL Files (*.mol,*.sdf,*.sd,*.mdl) Catalyst Files (*.cpd) Catalyst Query Files (*.chm) VRML World Files (*.wrl) Smiles Files (*.smi) GIF Files (*.gif) JPEG Files (*.jpg) DS ViewerPro Files (*.msv) (4)可导出的分数坐标文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) 2、Cartes软件的特色 （一）自动识别点群 象Chem3D这样专业的软件目前尚没有自动识别点群的功能，而GaussView的3.07以来的版本已经增加了此项功能，但是其准确程度令人担忧。似乎GaussView倾向于低估分子的对称性，例如它往往无法判断出高于6重轴的对称性，如碳管(7,7)，GaussView给出的点群是C2h，而实际是D7d；又比如碳管(5,5)，它认为其点群是C5，而实际是D5d。 可见自己动手写一个自动识别点群的程序是很具有挑战性的，于是我就写了这样的程序，现在正好把它集成到Cartes软件里来了。 （二） 自动调整分子取向 自动将分子的主轴调整到x,y,z轴上。 自动将分子的自定义的某个轴调整到自定义的另外一个轴上。 （三）对称操作矩阵自动生成向导 在进行对称操作时，原先需要自行输入变换矩阵，这往往要求用户自己推求矩阵元，因而极为不方便。 现在我加入了对称操作矩阵自动生成向导，可以十分方便地按照对称变换自动生成变化矩阵。我想这是一个令人振奋的改进！ （四）通过空间群自动添加操作矩阵 严格按照各个空间群的对称性关系自动来添加对称操作矩阵，这应该是继对称操作矩阵自动生成向导之后又一个明显方便有效的改进。 （五） 高精度的运算和转换 Chem3D虽然有旋转等对称操作，但转换的精度有时并不能满足需要，往往破坏了对称性，而Cartes的精度高达小数点后14位，任意次的转换仍然能保持原有的点群对称性。 （六）多种文件格式的兼容和互转 如果有可能的话，以后我还会兼容其他文件格式——比如Gaussian等量化软件的out文件等等。 （七） 语言切换 有中文和英文两种语言的支持。 （八） Office XP界面 另外还采用了真彩色菜单的技术，进一步美化了界面。 （九） 绿色软件 无需安装，直接运行，不产生垃圾文件，不对注册表进行操作。 |
回复此楼» 猜你喜欢
普瓦捷环境与材料化学研究所 (IC2MP)博后招聘
已经有0人回复
-
香港科技大学(广州)方超课题组招聘全奖博士
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有192人回复
-
宁夏大学化学工程与技术专业招收博士研究生
已经有1人回复
-
南京大学软物质计算模拟方向硕博连读/直博生招生
已经有0人回复
-
微纳hub，微纳加工的宝库
已经有0人回复
-
微纳加工里的 lift-off 工艺
已经有0人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
美国杰克逊州立大学周剑歌教授的化学计算与AI实验室诚招博士后研究员
已经有3人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2009-07-20 22:32:04
4楼2010-03-11 19:38:43
5楼2010-03-15 08:34:12
简单回复
lz8306173楼
2009-07-21 20:22
回复
谢谢分享！
15