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[交流] 6分eRNA文章套路视频(增强子RNA/泛癌数据分析)

6分eRNA文章套路视频(增强子RNA/泛癌数据分析)
                                                                                            --生信自学网
        今天我们给大家讲解下6分eRNA文章套路，其参考文献是” AP001056.1, A Prognosis-Related Enhancer RNA in Squamous Cell Carcinoma of the Head and Neck”。根据前人研究的结果，得到了增强子RNA和它的靶基因。生信自学网eRNA文章套路的核心思想是在泛癌中验证前人研究的结果，找出与生存相关的eRNA，并验证eRNA和它靶基因的相关性。
        eRNA文章套路课程内容包括eRNA文章套路简介，软件准备，数据下载，表达数据id转换，eRNA，提取eRNA表达量，eRNA和生存数据合并，生存分析过滤，相关性分析过滤，临床相关性分析，临床样本统计，eRNA共表达分析，eRNA靶点id转换，GO富集分析，KEGG富集分析，特定Term中，泛癌表达，泛癌生存分析，泛癌生存验证，泛癌相关性验证。
        增强子元件作为非编码区的一段 DNA 序列，通过与特定转录因子结合强化基因转录，远距离增强目标基因的表达。增强子激活基因表达不依赖于它们与其靶基因的距离或方向。eRNA(enhancer RNA，增强子RNA)，是指增强子转录产生的RNA，长度为500bp-5kb。eRNAs可以激活增强子活性,也能与其它蛋白质因子结合促进增强子启动子环的形成,从而激活下游基因的表达,它还可能以独立的形式行驶某些生物学功能。eRNA的改变可影响癌细胞的细胞周期和细胞生长等生物过程，或改变目标基因表达，提示了eRNA可以作为新的肿瘤治疗靶点。

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1楼2020-06-05 19:33:59
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