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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】如何从一个 3D XSD结构图里得出他所有原子坐标
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stou

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ustc at 2009-7-13 08:20:
import--不就ok了！

确定吗？有个分数坐标和其他坐标之分吧？
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11楼2009-07-21 18:04:25
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阿勇

铜虫 (小有名气)
★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 7-22 17:16
你在MS的计算的文件夹里打开一个.xsd的文件，我看到的一般都是.cif格式的，你将.cif格式改为.txt的，然后打开，可以看到里面文件的内容，包括晶格三个矢量的大小和方向，你把你的数据改到里面去，注意：小数点后只有四位有效数字。还有就是每个原子的坐标，这里是一个例子。
data_3
_audit_creation_date              2008-09-08
_audit_creation_method            'Materials Studio'
_symmetry_space_group_name_H-M    'P1'
_symmetry_Int_Tables_number       1
_symmetry_cell_setting            triclinic
loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  x,y,z
_cell_length_a                    6.4024
_cell_length_b                    9.6045
_cell_length_c                    10.2712
_cell_angle_alpha                 90.0000
_cell_angle_beta                  90.0000
_cell_angle_gamma                 120.0022
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
a1 O     0.16298   0.21754   0.19092   0.00000  Uiso   1.00
O2 O     0.19050   0.23891   0.68355   0.00000  Uiso   1.00
C C     0.50000   0.50000   0.50000   0.00000  Uiso   1.00
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12楼2009-07-22 15:30:31
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
wuli8(金币+3,VIP+0):3ks 7-22 18:18
jiawdd(金币+3,VIP+0): 7-23 10:44
discover模块，setup，save file，会生成car和mdf文件（文件属性为隐藏）
car文件就是坐标
想生成xsd同理，按照car文件的格式写进去就行了
赞一下(22人) 回复此楼
13楼2009-07-22 17:18:38
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