应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】Molecular electrostatic potential (MEP) maps 分子静电势怎样计算？
232/3返回列表上一页123下一页
查看: 6971  |  回复: 22
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chg952

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
分子电势图（MEP，好深的东西
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2009-08-14 07:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feixiangya

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
听不懂想学，哪位大侠能够我推荐一本关于Molecular electrostatic potential (MEP) maps 分子静电势的最基础的书啊？谢谢
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2009-08-14 11:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
loovfnd(金币+5,VIP+0):感谢你认真的回帖！ 8-15 11:39
本论坛的一个贴子可读：
分子的静电势的物理意义与图形表达http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1091031&fpage=1

最关键的是静电势的定义：空间某点的静电势是指从无穷远处移动单位正电荷至该点时所需做的功。

G03可以方便地计算一个分子、化学实体指定空间各个格点的静电势的值，这上面的帖子已经介绍了。

我们一方面可以直接用这静电势来分析问题，另一方面可以将静电势与分子的电荷分布的性质联系起来考虑。
一个空间各个格点的静电势的值，它是全分子的，但我们可以选择不同的截面来观察静电势的值的分布，以及它所反映出来的电荷性质。
比如一个水的静电势图表明：O原子周围的静电势为负值，它是O原子pi（孤对电子），即正电荷与其有较强的相互作用，容易与之靠近；相反，电子则容易与静电势等值线正值高且密集处的H靠拢。但是在水分子中由于相应的轨道是正交的，只能在水分子之间才会产生氢键。

我们如果选择水分子平面作为截面，它就把H-O的静电势的值高且密集表现出来了。如果选择垂直水分子平面且均分水的夹角作为截面，就将O原子pi（孤对电子）充分展示了，见附图。
水的pi处的静电势为负值，蓬松发散，具有强亲核性。而水的H-O键处静电势为密集的正值，具有强亲电性。这就为氢键的形成提供了动力。
当然能否形成氢键，还要分析双方HOMO与LUMO的对称性是否允许。
赞一下(11人) 回复此楼
13楼2009-08-15 09:54:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
学习一下。
回复此楼
新手学习
14楼2009-09-01 08:03:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-7-16 14:13:
zhou2009大侠的跟帖挺好，呵呵，但是稍微有些麻烦
生成cube文件的方法，其实可以用一个命令就能达到目的。
zhou2009大侠生成MO和电子密度用了多步输入，其实，实现cubegen的功能，只需要如下1个命令
cubegen 0 ...

把服务器上的单点计算的文件所产生的checkpoint文件经如下途径转换化：
formchk 1.chk 1.fchk
再用如下方法，
cubegen 0 potential 1.fchk 1.cube 0 h
把产生的cube文件下载到windows系统的计算机上，用GV打开后，是否可以直接点击surface action而不用管cube action就可以直接作静电势图？
非常感谢。
赞一下(1人) 回复此楼
15楼2009-10-12 18:30:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2009-10-12 18:30:

把服务器上的单点计算的文件所产生的checkpoint文件经如下途径转换化：
formchk 1.chk 1.fchk
再用如下方法，
cubegen 0 potential 1.fchk 1.cube 0 h
把产生的cube文件下载到windows系统的计算机上，用GV打 ...

但是这样做出来的静电势图非常奇怪，是不是少了什么步骤。
用GV打开cube文件后点surfaces，发现cube actions里已经有内容，所以直接在surfaces actions作图。但结果离奇。
赞一下(1人) 回复此楼
16楼2009-10-12 21:03:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ustc

金虫 (著名写手)
好，不错。 关注！
回复此楼
17楼2010-02-10 09:20:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xifengjin

金虫 (正式写手)
哇塞，学习到了
回复此楼
18楼2010-12-24 12:54:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hzfish

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
建议初学者看看《Viewing Gaussian Structures with GaussView》！！
赞一下(1人) 回复此楼
19楼2010-12-25 15:39:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bernies

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
不是用本来的gaussian算的 自己写的程序 没有chk文件 gview只能画面 不能按照，分子表面着色  没办法
赞一下(1人) 回复此楼
20楼2011-12-29 15:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 loovfnd 的主题更新
232/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[职场人生] 40+中年人失业后，还能找到好工作吗？ +11 xqy2009 2026-10-13 13/650 2026-10-15 21:32 by bear2007
[有机交流] 用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么 +3 18834002860 2026-10-12 6/300 2026-10-15 14:30 by 长沙摩尔信息科�
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+7 David1982 2026-10-13 11/550 2026-10-15 10:30 by zyqchem
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +4 好运来～9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭