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crystalpang铜虫 (小有名气)
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【求助】HMM在生物信息学方面的应用
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想用HMM方法进行多条序列比对，在网上查了可用的软件，像HMMER，SAM好象都是只针对蛋白质序列的，我猜是因为DNA序列字符只有四种，所以效果不好。 问题是我需要进行多条核酸序列比对，而且不想事先设置比对替换矩阵和空位罚分，有什么其它方法能满足这个要求吗？好象Bayes aligner能做到，但我记忆中那个是做两条序列比对的，是否可以做多条序列呢？ 请各位赐教。 |
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2楼2009-07-01 10:12:47
crystalpang
铜虫 (小有名气)
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3楼2009-07-04 15:13:10