| 查看: 2099 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】Problem with the distance matrix已有2人参与
|
|||
|
我在用oniom优化一个分子筛晶体结构的时候，计算终止并提示Problem with the distance matrix. 有一部分原子时固定的，结构我是从CIF文件转化来的，请问如何解决这个问题，能继续优化下去？下面是输入的文件： %chk=G:\gaussian in and out\new28T\32-1.chk %mem=6MW %nproc=1 # opt oniom(b3lyp/6-31g(d):uff) geom=connectivity Title Card Required 0 2 0 2 0 2 Al-Al3 0 1.497500 -2.492900 -0.110100 H Si-Si3 -1 1.497500 5.057300 -0.110100 L Si-Si3 -1 -1.584500 -4.902700 4.436500 L Si-Si3 -1 -6.245600 5.702900 -0.318200 L Si-Si3 0 3.789400 -3.138500 -2.065400 H Si-Si3 -1 3.789400 5.702900 -2.065400 L Si-Si3 -1 -6.245600 -3.138500 -0.318200 L Si-Si3 -1 -5.639200 5.063400 2.581900 L Si-Si3 -1 -5.639200 -2.499000 2.581900 L Si-Si3 -1 -4.482800 -4.896600 -4.128100 L Si-Si3 -1 -2.492200 4.985600 2.600700 L Si-Si3 0 2.405200 -4.974400 1.725700 H Si-Si3 -1 -2.492200 -2.421200 2.600700 L Si-Si3 -1 -1.504900 5.709000 -0.281900 L Si-Si3 -1 1.417900 -4.251000 4.608300 L Si-Si3 0 -1.504900 -3.144600 -0.281900 H Si-Si3 -1 -3.825000 5.120500 -2.197000 L Si-Si3 -1 6.210000 -2.556100 -0.186600 L Si-Si3 -1 6.210000 5.120500 -0.186600 L Si-Si3 -1 -3.825000 -2.556100 -2.197000 L Si-Si3 -1 -1.584500 2.885900 4.501000 L Si-Si3 -1 1.497500 -7.074100 -0.174600 L Si-Si3 -1 -1.584500 -0.321500 4.501000 L Si-Si3 -1 -4.563700 2.832400 -4.055600 L Si-Si3 -1 5.471300 -0.268000 1.672000 L Si-Si3 -1 5.471300 2.832400 1.672000 L Si-Si3 -1 -4.563700 -0.268000 -4.055600 L Si-Si3 0 2.362400 -0.253400 1.802200 H Si-Si3 -1 2.362400 2.817800 1.802200 L Si-Si3 -1 -2.449400 -7.142200 2.524200 L Si-Si3 -1 1.365200 -1.100800 4.613700 L Si-Si3 -1 1.365200 3.665200 4.613700 L Si-Si3 -1 -1.452200 -6.294800 -0.287300 L O-O_3 0 2.509300 -2.372600 -1.330000 H O-O_3 -1 2.509300 4.937000 -1.330000 L O-O_3 -1 -6.255400 5.025700 1.141900 L O-O_3 -1 3.779600 -2.461300 -3.525500 L H-H_ 5 O-O_3 -1 -6.255400 -2.461300 1.141900 L O-O_3 -1 -4.043000 5.057300 2.516100 L O-O_3 -1 -4.043000 -2.492900 2.516100 L O-O_3 -1 -2.050000 5.124200 1.066800 L O-O_3 -1 1.963000 -4.835800 3.259600 L H-H_ 12 O-O_3 -1 -2.050000 -2.559800 1.066800 L H-H_ 16 O-O_3 -1 -2.417500 5.082900 -1.456200 L O-O_3 -1 -2.417500 -2.518500 -1.456200 L H-H_ 16 O-O_3 -1 -4.874800 5.385600 -1.081800 L O-O_3 -1 5.160200 -2.821200 -1.301800 L H-H_ 5 O-O_3 -1 5.160200 5.385600 -1.301800 L O-O_3 -1 -4.874800 -2.821200 -1.081800 L O-O_3 -1 3.932800 -0.627900 1.728400 L H-H_ 28 O-O_3 -1 3.932800 3.192300 1.728400 L O-O_3 -1 1.780500 -0.406600 3.171000 L H-H_ 28 O-O_3 -1 1.780500 2.971000 3.171000 L O-O_3 -1 -1.867500 -6.989000 1.155400 L O-O_3 -1 1.541600 -2.649800 4.502300 L O-O_3 -1 -1.628600 -4.745800 -0.175900 L H-H_ 16 O-O_3 0 1.780500 -1.192000 0.646700 H O-O_3 -1 1.780500 3.756400 0.646700 L O-O_3 -1 -1.867500 -6.203600 3.679700 L O-O_3 0 1.642100 -3.675900 1.058700 H O-O_3 -1 -1.729100 -3.719700 3.267700 L O-O_3 -1 -2.099000 3.672500 3.248900 L O-O_3 -1 2.012000 -6.287500 1.077500 L H-H_ 12 O-O_3 -1 -2.099000 -1.108100 3.248900 L O-O_3 -1 -3.750300 3.682200 -2.968600 L O-O_3 -1 6.284700 -1.117800 0.585000 L O-O_3 -1 6.284700 3.682200 0.585000 L O-O_3 -1 -3.750300 -1.117800 -2.968600 L O-O_3 -1 -4.131200 -3.638200 -3.231600 L O-O_3 -1 -0.011700 5.416000 -0.596000 L O-O_3 -1 -0.075300 -4.544000 4.922400 L O-O_3 0 -0.011700 -2.851600 -0.596000 H O-O_3 -1 -0.075300 -0.580400 4.951900 L O-O_3 -1 -0.075300 3.144800 4.951900 L O-O_3 -1 -0.011700 -6.815200 -0.625500 L O-O_3 -1 -1.495100 1.282200 4.172200 L O-O_3 -1 -4.337000 1.282200 -3.755100 L O-O_3 -1 5.698000 1.282200 1.371400 L O-O_3 -1 2.141900 1.282200 1.384800 L H-H_ 28 Si-Si3 -1 4.396000 -2.498600 -4.965500 L H-H_ -1 -2.625600 -4.699000 5.481300 L H-H_ -1 -2.496300 3.132400 5.652000 L H-H_ -1 -2.496300 -0.568000 5.652000 L H-H_ -1 3.781600 -1.427100 -5.797200 L H-H_ -1 4.107600 -3.816500 -5.595700 L H-H_ -1 5.863200 -2.257800 -4.884600 L H-H_ -1 -3.930961 -6.088186 -3.467422 L H-H_ -1 -5.951542 -4.902213 -4.188646 L H-H_ -1 -3.904851 -4.932440 -5.479244 L H-H_ -1 -3.956179 -0.646239 -5.339638 L H-H_ -1 -5.994147 -0.602623 -4.108039 L H-H_ -1 -3.956179 3.210639 -5.339638 L H-H_ -1 -5.994147 3.167023 -4.108039 L H-H_ -1 3.749102 7.171995 -2.097583 L H-H_ -1 3.780450 5.084407 -3.398924 L H-H_ -1 6.079173 -0.645773 2.956008 L H-H_ -1 6.079183 3.210088 2.956029 L H-H_ -1 3.871456 -4.906609 1.805688 L H-H_ 12 H-H_ -1 5.915442 -3.597056 0.808662 L H-H_ -1 7.510462 -2.521359 -0.871064 L H-H_ -1 7.510462 5.085759 -0.871064 L H-H_ -1 5.915442 6.161456 0.808662 L H-H_ -1 2.249266 -4.821368 5.678071 L H-H_ -1 1.417343 -8.512002 0.120207 L H-H_ -1 -2.247638 -8.547306 2.906130 L H-H_ -1 -3.877811 -6.801561 2.591327 L H-H_ -1 -5.965375 -3.666403 3.413573 L H-H_ -1 -6.191039 -1.307414 3.242578 L H-H_ -1 -6.286277 -4.607584 -0.286009 L H-H_ -1 -7.377035 -2.461548 -0.968194 L H-H_ -1 -2.467641 -6.530165 -1.323824 L H-H_ -1 2.393100 -6.730927 -1.288617 L H-H_ -1 3.748723 -4.607584 -2.097591 L H-H_ 5 H-H_ -1 1.624838 6.099073 0.919168 L H-H_ -1 1.531105 5.122045 4.508928 L H-H_ -1 2.380688 3.429825 5.650176 L H-H_ -1 2.380688 -0.865425 5.650176 L H-H_ -1 -6.191039 3.871814 3.242578 L H-H_ -1 -5.965375 6.230803 3.413573 L H-H_ -1 -7.377035 5.025948 -0.968194 L H-H_ -1 -6.285898 7.171995 -0.286017 L H-H_ -1 -4.119558 6.161456 -3.192262 L H-H_ -1 -1.618258 7.171421 -0.185075 L H-H_ -1 -1.811197 6.144402 3.195942 L 1 34 1.0 57 1.0 60 1.0 72 1.0 2 35 1.0 58 1.0 70 1.0 114 1.0 3 59 1.0 61 1.0 71 1.0 81 1.0 4 36 1.0 46 1.0 120 1.0 121 1.0 5 34 1.0 37 1.0 47 1.0 113 1.0 6 35 1.0 48 1.0 94 1.0 95 1.0 7 38 1.0 49 1.0 109 1.0 110 1.0 8 36 1.0 39 1.0 118 1.0 119 1.0 9 38 1.0 40 1.0 107 1.0 108 1.0 10 69 1.0 87 1.0 88 1.0 89 1.0 11 39 1.0 41 1.0 62 1.0 124 1.0 12 42 1.0 60 1.0 63 1.0 98 1.0 13 40 1.0 43 1.0 61 1.0 64 1.0 14 41 1.0 44 1.0 70 1.0 123 1.0 15 42 1.0 55 1.0 71 1.0 103 1.0 16 43 1.0 45 1.0 56 1.0 72 1.0 17 44 1.0 46 1.0 65 1.0 122 1.0 18 47 1.0 66 1.0 99 1.0 100 1.0 19 48 1.0 67 1.0 101 1.0 102 1.0 20 45 1.0 49 1.0 68 1.0 69 1.0 21 62 1.0 74 1.0 76 1.0 82 1.0 22 63 1.0 75 1.0 104 1.0 112 1.0 23 64 1.0 73 1.0 76 1.0 83 1.0 24 65 1.0 77 1.0 92 1.0 93 1.0 25 50 1.0 66 1.0 78 1.0 96 1.0 26 51 1.0 67 1.0 78 1.0 97 1.0 27 68 1.0 77 1.0 90 1.0 91 1.0 28 50 1.0 52 1.0 57 1.0 79 1.0 29 51 1.0 53 1.0 58 1.0 79 1.0 30 54 1.0 59 1.0 105 1.0 106 1.0 31 52 1.0 55 1.0 73 1.0 117 1.0 32 53 1.0 74 1.0 115 1.0 116 1.0 33 54 1.0 56 1.0 75 1.0 111 1.0 34 35 36 37 80 1.0 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 84 1.0 85 1.0 86 1.0 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 请各位高手帮忙啊，不胜感激  。搞了几天了，都要抓狂了 |
回复此楼» 猜你喜欢
中教金源的流动池
已经有0人回复
-
RSC ADV状态问题
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有216人回复
-
湖南大学招收锂离子电池、离子液体、高分子与凝胶材料、电催化方向博士生多名
已经有8人回复
-
南京大学蔡亮课题组诚招2026年申请-考核制博士生2-3名（电解水制氢，XAFS谱学等）
已经有32人回复
-
求助各位大佬配位化学学习教材！！！
已经有0人回复
-
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事
已经有10人回复
-
内蒙古大学青年长江学者王蕾教授课题组2026年博士招聘，2-3人
已经有11人回复
-
多相催化-2026年CSC博士及洪堡合作博士后招生！
已经有0人回复
-
中国地质大学（武汉）—国家级青年人才杨明教授组-招收博士-新能源材料化学及催化材料
已经有25人回复
-
求光催化产过氧化氢的PPT ！！！毕业答辩需要
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Partial Differential Equations And Boundary Value Problems With Maple（2ed）2009
已经有80人回复- 有限元利器Abaqus指导教材Analysis of Geotechnical Problems with ABAQUS【转载】
已经有118人回复
- 寻找过渡态一直出错，焦头烂额中
已经有13人回复
- Gaussian计算的随机性
已经有15人回复
- 【求助】请问这是什么错误？
已经有4人回复
- 【求助】用Gaussian进行结构优化
已经有19人回复
- 【求助】Gaussian SCRF 优化求助
已经有7人回复
- 【求助】gassian计算中出现的错误
已经有10人回复
5楼2011-03-18 10:52:33
2楼2009-09-05 08:56:06
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
- QC强帖: 38
- 应助: 165 (高中生)
- 贵宾: 16.999
- 金币: 553.8
- 散金: 39880
- 红花: 395
- 沙发: 2
- 帖子: 10406
- 在线: 1528.1小时
- 虫号: 448368
- 注册: 2007-11-01
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 科研工具资源
3楼2009-09-05 09:43:14
jw227
木虫 (著名写手)
课题组长
- 应助: 1 (幼儿园)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 3576.8
- 红花: 1
- 帖子: 1671
- 在线: 292.6小时
- 虫号: 236869
- 注册: 2006-04-03
- 性别: MM
- 专业: 天然有机化学
4楼2009-09-05 21:18:08