| 查看: 2184 | 回复: 5 | |||
[交流]
【求助】Problem with the distance matrix 已有2人参与
|
|
我在用oniom优化一个分子筛晶体结构的时候,计算终止并提示Problem with the distance matrix. 有一部分原子时固定的,结构我是从CIF文件转化来的,请问如何解决这个问题,能继续优化下去?下面是输入的文件: %chk=G:\gaussian in and out\new28T\32-1.chk %mem=6MW %nproc=1 # opt oniom(b3lyp/6-31g(d):uff) geom=connectivity Title Card Required 0 2 0 2 0 2 Al-Al3 0 1.497500 -2.492900 -0.110100 H Si-Si3 -1 1.497500 5.057300 -0.110100 L Si-Si3 -1 -1.584500 -4.902700 4.436500 L Si-Si3 -1 -6.245600 5.702900 -0.318200 L Si-Si3 0 3.789400 -3.138500 -2.065400 H Si-Si3 -1 3.789400 5.702900 -2.065400 L Si-Si3 -1 -6.245600 -3.138500 -0.318200 L Si-Si3 -1 -5.639200 5.063400 2.581900 L Si-Si3 -1 -5.639200 -2.499000 2.581900 L Si-Si3 -1 -4.482800 -4.896600 -4.128100 L Si-Si3 -1 -2.492200 4.985600 2.600700 L Si-Si3 0 2.405200 -4.974400 1.725700 H Si-Si3 -1 -2.492200 -2.421200 2.600700 L Si-Si3 -1 -1.504900 5.709000 -0.281900 L Si-Si3 -1 1.417900 -4.251000 4.608300 L Si-Si3 0 -1.504900 -3.144600 -0.281900 H Si-Si3 -1 -3.825000 5.120500 -2.197000 L Si-Si3 -1 6.210000 -2.556100 -0.186600 L Si-Si3 -1 6.210000 5.120500 -0.186600 L Si-Si3 -1 -3.825000 -2.556100 -2.197000 L Si-Si3 -1 -1.584500 2.885900 4.501000 L Si-Si3 -1 1.497500 -7.074100 -0.174600 L Si-Si3 -1 -1.584500 -0.321500 4.501000 L Si-Si3 -1 -4.563700 2.832400 -4.055600 L Si-Si3 -1 5.471300 -0.268000 1.672000 L Si-Si3 -1 5.471300 2.832400 1.672000 L Si-Si3 -1 -4.563700 -0.268000 -4.055600 L Si-Si3 0 2.362400 -0.253400 1.802200 H Si-Si3 -1 2.362400 2.817800 1.802200 L Si-Si3 -1 -2.449400 -7.142200 2.524200 L Si-Si3 -1 1.365200 -1.100800 4.613700 L Si-Si3 -1 1.365200 3.665200 4.613700 L Si-Si3 -1 -1.452200 -6.294800 -0.287300 L O-O_3 0 2.509300 -2.372600 -1.330000 H O-O_3 -1 2.509300 4.937000 -1.330000 L O-O_3 -1 -6.255400 5.025700 1.141900 L O-O_3 -1 3.779600 -2.461300 -3.525500 L H-H_ 5 O-O_3 -1 -6.255400 -2.461300 1.141900 L O-O_3 -1 -4.043000 5.057300 2.516100 L O-O_3 -1 -4.043000 -2.492900 2.516100 L O-O_3 -1 -2.050000 5.124200 1.066800 L O-O_3 -1 1.963000 -4.835800 3.259600 L H-H_ 12 O-O_3 -1 -2.050000 -2.559800 1.066800 L H-H_ 16 O-O_3 -1 -2.417500 5.082900 -1.456200 L O-O_3 -1 -2.417500 -2.518500 -1.456200 L H-H_ 16 O-O_3 -1 -4.874800 5.385600 -1.081800 L O-O_3 -1 5.160200 -2.821200 -1.301800 L H-H_ 5 O-O_3 -1 5.160200 5.385600 -1.301800 L O-O_3 -1 -4.874800 -2.821200 -1.081800 L O-O_3 -1 3.932800 -0.627900 1.728400 L H-H_ 28 O-O_3 -1 3.932800 3.192300 1.728400 L O-O_3 -1 1.780500 -0.406600 3.171000 L H-H_ 28 O-O_3 -1 1.780500 2.971000 3.171000 L O-O_3 -1 -1.867500 -6.989000 1.155400 L O-O_3 -1 1.541600 -2.649800 4.502300 L O-O_3 -1 -1.628600 -4.745800 -0.175900 L H-H_ 16 O-O_3 0 1.780500 -1.192000 0.646700 H O-O_3 -1 1.780500 3.756400 0.646700 L O-O_3 -1 -1.867500 -6.203600 3.679700 L O-O_3 0 1.642100 -3.675900 1.058700 H O-O_3 -1 -1.729100 -3.719700 3.267700 L O-O_3 -1 -2.099000 3.672500 3.248900 L O-O_3 -1 2.012000 -6.287500 1.077500 L H-H_ 12 O-O_3 -1 -2.099000 -1.108100 3.248900 L O-O_3 -1 -3.750300 3.682200 -2.968600 L O-O_3 -1 6.284700 -1.117800 0.585000 L O-O_3 -1 6.284700 3.682200 0.585000 L O-O_3 -1 -3.750300 -1.117800 -2.968600 L O-O_3 -1 -4.131200 -3.638200 -3.231600 L O-O_3 -1 -0.011700 5.416000 -0.596000 L O-O_3 -1 -0.075300 -4.544000 4.922400 L O-O_3 0 -0.011700 -2.851600 -0.596000 H O-O_3 -1 -0.075300 -0.580400 4.951900 L O-O_3 -1 -0.075300 3.144800 4.951900 L O-O_3 -1 -0.011700 -6.815200 -0.625500 L O-O_3 -1 -1.495100 1.282200 4.172200 L O-O_3 -1 -4.337000 1.282200 -3.755100 L O-O_3 -1 5.698000 1.282200 1.371400 L O-O_3 -1 2.141900 1.282200 1.384800 L H-H_ 28 Si-Si3 -1 4.396000 -2.498600 -4.965500 L H-H_ -1 -2.625600 -4.699000 5.481300 L H-H_ -1 -2.496300 3.132400 5.652000 L H-H_ -1 -2.496300 -0.568000 5.652000 L H-H_ -1 3.781600 -1.427100 -5.797200 L H-H_ -1 4.107600 -3.816500 -5.595700 L H-H_ -1 5.863200 -2.257800 -4.884600 L H-H_ -1 -3.930961 -6.088186 -3.467422 L H-H_ -1 -5.951542 -4.902213 -4.188646 L H-H_ -1 -3.904851 -4.932440 -5.479244 L H-H_ -1 -3.956179 -0.646239 -5.339638 L H-H_ -1 -5.994147 -0.602623 -4.108039 L H-H_ -1 -3.956179 3.210639 -5.339638 L H-H_ -1 -5.994147 3.167023 -4.108039 L H-H_ -1 3.749102 7.171995 -2.097583 L H-H_ -1 3.780450 5.084407 -3.398924 L H-H_ -1 6.079173 -0.645773 2.956008 L H-H_ -1 6.079183 3.210088 2.956029 L H-H_ -1 3.871456 -4.906609 1.805688 L H-H_ 12 H-H_ -1 5.915442 -3.597056 0.808662 L H-H_ -1 7.510462 -2.521359 -0.871064 L H-H_ -1 7.510462 5.085759 -0.871064 L H-H_ -1 5.915442 6.161456 0.808662 L H-H_ -1 2.249266 -4.821368 5.678071 L H-H_ -1 1.417343 -8.512002 0.120207 L H-H_ -1 -2.247638 -8.547306 2.906130 L H-H_ -1 -3.877811 -6.801561 2.591327 L H-H_ -1 -5.965375 -3.666403 3.413573 L H-H_ -1 -6.191039 -1.307414 3.242578 L H-H_ -1 -6.286277 -4.607584 -0.286009 L H-H_ -1 -7.377035 -2.461548 -0.968194 L H-H_ -1 -2.467641 -6.530165 -1.323824 L H-H_ -1 2.393100 -6.730927 -1.288617 L H-H_ -1 3.748723 -4.607584 -2.097591 L H-H_ 5 H-H_ -1 1.624838 6.099073 0.919168 L H-H_ -1 1.531105 5.122045 4.508928 L H-H_ -1 2.380688 3.429825 5.650176 L H-H_ -1 2.380688 -0.865425 5.650176 L H-H_ -1 -6.191039 3.871814 3.242578 L H-H_ -1 -5.965375 6.230803 3.413573 L H-H_ -1 -7.377035 5.025948 -0.968194 L H-H_ -1 -6.285898 7.171995 -0.286017 L H-H_ -1 -4.119558 6.161456 -3.192262 L H-H_ -1 -1.618258 7.171421 -0.185075 L H-H_ -1 -1.811197 6.144402 3.195942 L 1 34 1.0 57 1.0 60 1.0 72 1.0 2 35 1.0 58 1.0 70 1.0 114 1.0 3 59 1.0 61 1.0 71 1.0 81 1.0 4 36 1.0 46 1.0 120 1.0 121 1.0 5 34 1.0 37 1.0 47 1.0 113 1.0 6 35 1.0 48 1.0 94 1.0 95 1.0 7 38 1.0 49 1.0 109 1.0 110 1.0 8 36 1.0 39 1.0 118 1.0 119 1.0 9 38 1.0 40 1.0 107 1.0 108 1.0 10 69 1.0 87 1.0 88 1.0 89 1.0 11 39 1.0 41 1.0 62 1.0 124 1.0 12 42 1.0 60 1.0 63 1.0 98 1.0 13 40 1.0 43 1.0 61 1.0 64 1.0 14 41 1.0 44 1.0 70 1.0 123 1.0 15 42 1.0 55 1.0 71 1.0 103 1.0 16 43 1.0 45 1.0 56 1.0 72 1.0 17 44 1.0 46 1.0 65 1.0 122 1.0 18 47 1.0 66 1.0 99 1.0 100 1.0 19 48 1.0 67 1.0 101 1.0 102 1.0 20 45 1.0 49 1.0 68 1.0 69 1.0 21 62 1.0 74 1.0 76 1.0 82 1.0 22 63 1.0 75 1.0 104 1.0 112 1.0 23 64 1.0 73 1.0 76 1.0 83 1.0 24 65 1.0 77 1.0 92 1.0 93 1.0 25 50 1.0 66 1.0 78 1.0 96 1.0 26 51 1.0 67 1.0 78 1.0 97 1.0 27 68 1.0 77 1.0 90 1.0 91 1.0 28 50 1.0 52 1.0 57 1.0 79 1.0 29 51 1.0 53 1.0 58 1.0 79 1.0 30 54 1.0 59 1.0 105 1.0 106 1.0 31 52 1.0 55 1.0 73 1.0 117 1.0 32 53 1.0 74 1.0 115 1.0 116 1.0 33 54 1.0 56 1.0 75 1.0 111 1.0 34 35 36 37 80 1.0 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 84 1.0 85 1.0 86 1.0 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 请各位高手帮忙啊,不胜感激 。搞了几天了,都要抓狂了 |
» 猜你喜欢
中国水产科学研究院黄海水产研究所博士后科研工作站2026年博士后招收公告
已经有0人回复
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事(氢能)
已经有10人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有254人回复
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有6人回复
意大利米兰理工大学急聘CSC公派留学博士生(物理或无机材料科学方向)
已经有47人回复
求加氢处理工艺与工程(第二版)pdf 李大东 中国石化出版社 9787511436689
已经有0人回复
新加坡ASTAR招收CSC或学校资助联培博士生/访问学生
已经有2人回复
求助Amsterdam Density Functional
已经有2人回复
武汉纺织大学全国重点实验室陈嵘教授团队招收2026级学术/专业型硕士研究生
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
Partial Differential Equations And Boundary Value Problems With Maple(2ed)2009
已经有80人回复
有限元利器Abaqus指导教材Analysis of Geotechnical Problems with ABAQUS【转载】
已经有118人回复
寻找过渡态一直出错,焦头烂额中
已经有13人回复
Gaussian计算的随机性
已经有15人回复
【求助】请问这是什么错误?
已经有4人回复
【求助】用Gaussian进行结构优化
已经有19人回复
【求助】Gaussian SCRF 优化求助
已经有7人回复
【求助】gassian计算中出现的错误
已经有10人回复
2楼2009-09-05 08:56:06
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
- QC强帖: 38
- 应助: 165 (高中生)
- 贵宾: 16.999
- 金币: 554.6
- 散金: 39880
- 红花: 395
- 沙发: 2
- 帖子: 10406
- 在线: 1528.1小时
- 虫号: 448368
- 注册: 2007-11-01
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 科研工具资源
3楼2009-09-05 09:43:14
jw227
木虫 (著名写手)
课题组长
- 应助: 1 (幼儿园)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 3576.8
- 红花: 1
- 帖子: 1671
- 在线: 292.6小时
- 虫号: 236869
- 注册: 2006-04-03
- 性别: MM
- 专业: 天然有机化学

4楼2009-09-05 21:18:08
5楼2011-03-18 10:52:33
6楼2019-06-18 21:07:31













。搞了几天了,都要抓狂了
回复此楼