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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】dmol3
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jilly7860

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】dmol3

刚接触MS，想请教一个问题
我用dmol3做的咪唑类阳离子的电子云密度，TASK选的几何优化，properties选的是electron density，出来结果后，用analysis分析，选electron density ,view 后出现一个图，即在优化的的结构上覆盖了一层蓝色的电子云， 我这样做对吗？这个图有什么用？然后，我想做一个透明图，标注上每一个原子的电荷，我该怎么做？
看到有一帖子上说是用CASTAP计算电荷密度，但是我怎么没有找到呢，只有一个electron density difference。
因要写毕业论文，面临答辩，急！望高手指点，不胜感激！
金币不多，全盘送出！谢谢！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 12:38 ]
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1楼 2009-05-27 15:52:45
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jilly7860

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by linglixia at 2009-5-27 16:57:
标注每一个原子的电荷，我可以帮你，就是analysis----population analysis---assign，然后到你的结构面，右键--label---charge----apply，每个原子的电荷就有了

谢谢，我按你的方法做了，出来结果了，真的很感谢！

[ Last edited by jilly7860 on 2009-5-28 at 11:45 ]
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5楼2009-05-28 11:35:24
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ynu88

至尊木虫 (文坛精英)

真聪
★
jilly7860(金币+1,VIP+0):不是很详细，也可能是我基础太差，，没明白，但还是谢谢你！。 5-28 11:27
你可以作某一晶面的等电荷密度图！
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2楼2009-05-27 16:22:06
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jilly7860

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ynu88 at 2009-5-27 16:22:
你可以作某一晶面的等电荷密度图！

您能否再详细点？我不太明白你的意思，是在电子云密度图上做一个切面吗？
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3楼2009-05-27 16:32:12
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linglixia

铜虫 (正式写手)
★ ★
jilly7860(金币+2,VIP+0): 5-28 11:45
标注每一个原子的电荷，我可以帮你，就是analysis----population analysis---assign，然后到你的结构面，右键--label---charge----apply，每个原子的电荷就有了
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4楼2009-05-27 16:57:27
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