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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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[交流]
【求助】gromacs中“non-default goups in your mdp file”错误
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大家好，请教一下： 我用gromacs运行，mdrun时md.mdp文件如下: ; Berendsen temperature coupling is on in three groups Tcoupl = v-rescale tau_t = 0.1 0.1 0.1 0.1 tc_grps = Protein_A SIM SOL NA+ ref_t = 310 310 310 310 top文件如下： [ molecules ] ; Compound #mols Protein_A 1 SIM 1 SOL 46639 NA+ 2 但是在运行时却出现如下错误，请问是哪里有问题了？ Fatal error: Group Protein_A not found in indexfile. Maybe you have non-default goups in your mdp file, while not using the '-n' option of grompp. In that case use the '-n' option. [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:46 ] |
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xuefei06
木虫 (正式写手)
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